Présentation
Coordination
Comité Scientifique
Équipes
Laboratory
Génétique Humaine et Fonctions Cognitives
Thomas Bourgeron
Laboratory
Génomique Évolutive des Microbes
Eduardo Rocha
Laboratory
Imagerie et modélisation
Christophe Zimmer
Laboratory
Epidémiologie des Maladies Emergentes
Arnaud Fontanet
Laboratory
Bioinformatique structurale
Michael Nilges
Laboratory
Génomique évolutive des virus à ARN
Etienne Simon-Loriere
Platform
Hub de Bioinformatique et Biostatistique
Marie-Agnès Dillies
Laboratory
Génétique Évolutive Humaine
Lluis Quintana-Murci
Laboratory
Modélisation Mathématique des Maladies Infectieuses
Simon Cauchemez
Laboratory
Régulation Spatiale des Génomes
Romain Koszul
Laboratory
Anthropologie et Ecologie de l’Emergence des Maladies
Tamara Giles-Vernick
Platform
Biomics
Marc Monot
Platform
Tech Lab
Michael Nilges
Laboratory
Analyse d’Images Biologiques
Jean-Christophe Olivo-Marin
Platform
Pôle de Coordination de la Recherche Clinique
Nathalie Jolly
Platform
Plateforme de Cytométrie
Sophie Novault
Laboratory
Immunité innée
James Di Santo
Laboratory
Microenvironnement et immunité
Gérard Eberl
Laboratory
Biologie et Génétique de la Paroi Bactérienne
Ivo Gomperts Boneca
Laboratory
Écologie et Émergence des Pathogènes Transmis par les Arthropodes
Anavaj Sakuntabhai
Laboratory
UMR
Biologie des Infections
Marc Lecuit
Laboratory
InBio: Méthodes expérimentales et computationnelles pour la modélisation des processus cellulaires
Grégory Batt
Laboratory
Génétique Statistique
Hugues Aschard
Laboratory
Biomédecine Computationelle des Systèmes
Benno Schwikowski
Laboratory
Décision et processus Bayesiens
Jean-Baptiste Masson
Laboratory
Environnement et risques infectieux
Jean-Claude Manuguerra
Laboratory
Biologie cellulaire des Trypanosomes
Philippe Bastin
Laboratory
Plasticité du Génome Bactérien
Didier Mazel
Laboratory
Virologie structurale
Félix Rey
Laboratory
Arbovirus et Insectes Vecteurs (AIV)
Anna-Bella Failloux
Laboratory
Génétique des Biofilms
Jean-Marc Ghigo
Laboratory
Parasitologie moléculaire et Signalisation
Gérald Spaeth
Laboratory
Biologie et Pathogénicité fongiques
Christophe D’Enfert
Laboratory
Biologie des ARN des Pathogènes Fongiques
Guilhem Janbon
Laboratory
Perception & Action
Pierre-Marie Lledo
Laboratory
Neurobiologie intégrative des systèmes cholinergiques
Uwe Maskos
UTechS
Spectrométrie de Masse pour la Biologie (UTechS MSBio)
Julia Chamot-Rooke
Laboratory
Architecture et Dynamique des Macromolécules Biologiques
Marc Delarue
Laboratory
Mécanismes de l’hérédité épigénétique
Germano Cecere
Laboratory
Dynamique des Décisions de Développement chez la Drosophile
François Schweisguth
Laboratory
Dynamic Regulation of Morphogenesis
Jérôme Gros
Laboratory
Morphogenèse du coeur
Sigolène Meilhac
Platform
BioImagerie Ultrastructurale
Adeline Mallet
UTechS
Platform
BioImagerie Photonique (UTechS PBI)
Spencer Shorte
Laboratory
G5
Algorithmes pour les séquences biologiques
Rayan Chikhi
Appels
Funded Projects
2023
D2I PhD Project
- Juliette Bellangier (PhD Fellow) – Isabelle Rosinski-Chupin (IP) & Olivier Tenaillon (INSERM)
- Camille Schneider (PhD Fellow) – Sylvain Brisse (IP) & Lulla Opatowski (IP)
- Raphaël Malak (PhD Fellow) – Rayan Chikhi (IP) & Hugues Aschard (IP)
2022
D2I PhD Project
- Eli Barthome (PhD Fellow) – Richard Delorme (IP) & Thomas Bourgeron (IP)
- Laura Xénard (PhD Fellow) – Daria Bonazzi (IP) & Guillaume Duménil (IP)
- Mohamed Mounib Benimam (PhD Fellow) – Jean-Christophe Olivo-Marin (IP) & Lucie Peduto (IP)
- Alex Westbrook (PhD Fellow) – Julien Mozziconaci (MNHN/CNRS) & Romain Koszul (IP)
2021
G5 Research Project
- Machine Learning for Integrative Biology – Laura Cantini
- Evolutionary Dynamics of Infectious Diseases – Sebastian Duchene-Garzon
D2I PhD Project
- Simon Galmiche (PhD Fellow) – Arnaud Fontanet (IP) & Simon Cauchemez (IP)
- Mathilde Grimée (PhD Fellow) – Simon Cauchemez (IP) & Michael White (IP)
P2I Collaborative Research Project
- Merging quantitative imaging and statistical modeling to quantify the impact of dengue virus infection on mosquito blood-feeding behavior (BitesGoingViral). Felix Hol (IP), Louis Lambrechts (IP), Jean-Baptiste Masson (IP) and Christian Vestergaard (IP)
- Modelling the role of microbiota in the acquisition and transmission of antibiotic resistant pathogenic bacteria (MICROMOD). Béatrice Laroche (INRAE), Lulla Opatowski (IP) and Didier Guillemot (IP)
2020
G5 Research Project
- Infectious Disease Epidemiology – Michael White
- Comparative Functional Genomics – Camille Berthelot
D2I PhD Project
- Andrew Holtz (PhD Fellow) – Hervé Bourhy (IP) & Anna Zhukova (IP)
- Maria Lopopolo (PhD Fellow) – Nicolas Rascovan (IP) & Lluis Quintana-Murci (IP)
- Cantin Ortiz (PhD Fellow) Christoph Schmidt-Hieber (IP) & Uwe Maskos (IP)
- Viktoriia Gruss (PhD Fellow) Grégory Batt (IP) & Imane El-Meouche (IAME, INSERM/APHP)
P2I Collaborative Research Project
- Integrative genetics and brain research on autism/ neurodevelopmental disorders in france. Thomas Bourgeron (IP), Richard Delorme (AP-HP) and Jean-François Deleuze (CEA).
- Pluridisciplinary characterization of double-strand break repair at single-cell level. Guy-Franck Richard (IP) & Charles Baroud (IP).
- Artificial intelligence for antibiotic drugs (AI4AB). Ivo Gomperts Boneca (IP) Nathalie Aulner (IP), Spencer Shorte (IP), Soojin Jang (IP Korea) and Christophe Zimmer (IP)
2019
G5 Research Project
- Microbial Paleogenomics – Nicolas Rascovan
D2I PhD Project
- Vincent Mallet (PhD Fellow) – Michael Nilges (IP) & Jean-Philippe Vert (MINES ParisTech)
- Armin Shoushtarizadeh (PhD Fellow) – Thomas Gregor (IP) & Pablo Navarro-Gil (IP)
- Chiara Figazzolo (PhD Fellow) – Marcel Hollenstein (IP) & Paola Arimondo (IP)
- Mariana Gonzalez (PhD Fellow) – Arnaud Blondel (IP) & Pierre-Jean Corringer (IP)
P2I Collaborative Research Project
- Identifying Tunneling Nanotube-like Structures in the Developing Cerebellum. Chiara Zurzolo (IP) & Jean-Baptiste Masson (IP).
- Path2Resistance: Deciphering evolutionary trajectories to characterize emergence and dissemination of multidrug resistant Escherichia coli. Eduardo Rocha (IP), Philippe Glaser (IP), Amaury Lambert (CIRB, Collège de France), and Guillaume Achaz (CIRB, Collège de France).
- Computational analysis of 3D cell architecture : application in quantifying myocardium orientation at the cellular and tissue levels. Sigolène Meilhac (IP/Institut Imagine) & Jean-Christophe Olivo-Marin (IP)
- Aptamer-labeling as a strategy to determine the structure of macromolecular assemblies. Marcel Hollenstein (IP), Ricardo Pellarin (IP), Eric Durand (Inserm)
2018
P2I Collaborative Research Project
- Machine learning to get at the heart of diagnostic cardiology Sigolène Meilhac, G5 (IP/Imagine), Timothy Wai, G5 (IP), Christophe Zimmer Unit (IP), Francesca Raimondi (APHP/INSERM).
- HOST AND BACTERIAL FACTORS INVOLVED IN INVASIVE LISTERIOSIS Marc Lecuit Unit (IP/INSERM), Lluis Quintana Unit (IP/CNRS), Hugues Aschard, G5 (IP).
G5 Research Project
- Sequence Bioinformatics – Rayan Chikhi
D2I PhD Project
- Marie Morel (PhD Fellow) – Olivier Gascuel Unit, Etienne Simon Loriere G5 (IP).
- Robin Chalumeau (PhD Fellow) – Jean-Christophe Olivo-Marin Unit, Jost Eninnga Unit (IP).
2017
G5 Research Project
D2I PhD Project
- Jérémy CHOIN (PhD Fellow) – Lluis Quintana Unit, Antoine Gessain Unit (IP).
- Jonathan Bastard (PhD fellow) – Lulla Opatowski (Didier Guillemot Unit, IP), Laura Temime (Cnam).
P2I Collaborative Research Project
- Understanding whooping cough resurgence in Europe by combining genomic, epidemiological and sociological approaches Sylvain Brisse, Simon Cauchemez.
- Microbial and viral circulations among people and wild and domesticated animals in an ecotone, Democratic Republic of Congo (MICROTONE) IP: Tamara Giles-Vernick, Sean Kennedy, Etienne Simon-Lorière, Victor Narat, Romain Duda (postdoc fellow) Université Paris-Diderot : Guillaume Lachenal.