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Présentation

L’Unité Biologie et Pathogénicité Fongiques à l’Institut Pasteur étudie les levures responsables d’infections chez l’Homme. Ces infections ont vu leur nombre augmenter considérablement au cours des vingt dernières années. Ceci reflète l’utilisation accrue des traitements immuno-suppresseurs et des procédures chirurgicales invasives ainsi que le vieillissement de la population. Dans les pays développés, les infections fongiques représentent une des principales causes d’infections nosocomiales.

Les levures hémiascomycètes du genre Candida, en particulier Candida albicans, sont responsables de la majorité des infections fongiques disséminées observées chez les patients en soins intensifs, sous chimiothérapie ou en attente d’une transplantation. Plus de 400.000 cas de ces infections souvent mortelles sont recensées mondialement, conduisant à environ 200.000 décès par an. Les candidoses sont donc un véritable problème de santé publique du fait de la forte mortalité qui leur est associée et ceci malgré la disponibilité de traitements antifongiques et d’autres approches thérapeutiques.

Une meilleure connaissance générique des levures du genre Candida ainsi que de la physiopathologie des infections dont elles sont responsables devraient permettre d’aboutir à une meilleure prise en charge des patients atteints de candidoses. Dans ce contexte l’Unité Biologie et Pathogénicité Fongiques à l’Institut Pasteur met en œuvre des recherches sur trois thèmes principaux :

La recherche sur ces différents thèmes s’appuie sur des outils de génomique fonctionnelle développés dans l’Unité. En particulier, nous avons développé avec le groupe de C. Munro (Université d’Aberdeen, Royaume Uni), l’ORFeome de C. albicans, une collection de plus de 5200 plasmides porteurs des ORFs de C. albicans et sommes entrain d’établir des collections de plasmides et souches de surexpression pour ces ORFs.

L’Unité Biologie et Pathogénicité Fongiques fait partie du Département Mycologie de l’Institut Pasteur. Elle est aussi associée au Département génomes et Génétique de l’Institut Pasteur et au département Microbiologie et Chaîne Alimentaire de l’Institut National de la Recherche Agronomique (USC 2019).

 

Membres

Projets

Projet Transversal

Équipements

Sunrise (4) • Tecan • Sunrise (4)

Group of 4 plate-readers, absorbance, temperature control, microplate shaking kinetics Location : Fernbach – 4 – 68-E4-17 Personnes à contacter : Natacha Sertour (natacha.sertour@pasteur.fr or tel: 8619) Unité Biologie et Pathogénicité Fongiques Unités autorisées […]

Infinite 200 • Tecan • Infinite 200

Plate-reader, fluorescence (top and bottom), luminescence and absorbance, temperature control, microplate shaking, kinetics, equipped with an injector Location : Fernbach – 4 – 68-E4-17 Personnes à contacter : Natacha Sertour (natacha.sertour@pasteur.fr or tel: 8619) […]

PHENOBOOT • Singer • PHENOBOOT

The PhenoBooth Colony Counter is a fast, super-easy to use, closed-chamber Colony Counter for imaging and analysis of colonies on agar. It uses a scientific grade, 13 megapixel HD camera and 4-channel, flat-field SpectraStar™ […]

ROTOR HDA • Singer • ROTOR HDA

Bench-top robot for the picking and replating of yeast, fungi, bacteria and algae colonies at densities 96, 384, 1536 and 6144. Can be used for duplicating mutant and clone libraies, re-plating cells from liquid […]

MacsQuant • Miltenyi Biotech • MacsQuant

3-colour benchtop flow-cytometer (405, 488, 635 nm), 96-well plate handler Location : Fernbach – 4 – 68-E4-17 Personnes à contacter: Mélanie Legrand (melanie.legrand@pasteur.fr or tel: 3126) Unité Biologie et Pathogénicité Fongiques Unités autorisées à […]

GentleMacs Dissociator • Miltenyi Biotech • GentleMacs Dissociator

The gentleMACS™ Dissociator is a benchtop instrument for the semi-automated dissociation of tissues into single-cell suspensions or thorough homogenates. A single sample or two samples in parallel can be processed. Two types of unique […]

Financements

Publications

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(EN) Our manuscript describing the genome sequences of 182 Candida albicans isolates and evidencing recombination events is now published in Nature Communications (May 2018). see https://rdcu.be/UEOT.

The Fungal Biology and Pathogenicity Unit is awarded funding from The European Commission (May 2018).
The FunHoMic Marie Sklodowska-Curie Initial Training Network, coordinated by Christophe d’Enfert, will define and exploit the Fungal-Host-Microbiota interplay to identify novel biomarkers (fungal or host genetic polymorphisms, microbiota profiles, metabolites or immune markers) for the stratification of a patient’s risk of serious fungal infection. This will pave the way for precision medicine in patient management through preventive or therapeutic interventions using antifungals, immune modulators or Live Biotherapeutic Products (LBPs).
Thirteen PhD fellowships will be available through FunHoMic at academic and biotech partner’s laboratories in France (Institut Pasteur, BIOASTER, biose), Belgium (ProDigest), Germany (Hans Knoell Institute), The Netherlands (Radboud UMC, Mimetas), Spain (VHIR), Switzerland (U. Zürich) and UK (Aberdeen U).

The Fungal Biology and Pathogenicity Unit is awarded funding from the Swiss National Science Foundation under the Sinergia program to study genetic determinants of Candida albicans pathogenicity (May 2017)
An interdisciplinary SNSF-funded Sinergia project has been awarded to the University of Zürich (Prof. Salomé LeibundGut), University of Lausanne (Prof. Dominique Sanglard), Ecole Polytechnique Fédérale Lausanne (Dr. Sandor Kasas) and Institut Pasteur (Dr. Christophe d’Enfert and Dr. Guillaume Laval).
The project focuses on the fungal pathogen Candida albicans and is aimed to identify fungal genetic factors associated with the variability in the outcomes of fungal-host interactions. Genetic factors will be identified using several parallel approaches based on the association of diverse phenotypes (obtained in vitro, in vivo and through transcriptomics) with whole genomes data from a collection of clinical isolates.

Dr. Jeanne Ropars, post-doctoral fellow in the Fungal Biology and Pathogenicity Unit, is appointed at the CNRS (june 2017)
From 2018, Jeanne will join the Laboratoire d’Ecologie, Systématique et Evolution to work on genome evolution in fungi used for cheese-making.

Dr. Mennat El-Ghalid, post-doctoral fellow in the Fungal Biology and Pathogenicity Unit, becomes one of the 21 2017 TED Global Fellows (may 2017)
The TED Fellows program provides transformational support to an international community of 436 visionaries who collaborate across disciplines to create positive change around the world. Mennat El Ghalid will deliver a talk at TED Global this August in Arusha, Tanzania joining a growing list of 436 other Fellows from 94 countries around the world. It will be the first time in a decade that TED will be held in Africa. see news on CNN website

 Dr. Sadri Znaidi, scientist at Institut Pasteur in Tunis, is awarded the status of affiliate researcher of the Institut Pasteur International Network, to work in the Fungal Biology and Pathogenicity Unit (march 2017)
Dr. Sadri Znaidi, assistant biologist at the Laboratory of Molecular Microbiology, Vaccinology and Biotechnological Development at the Institut Pasteur in Tunis, was awarded the status of affiliate researcher of the Institut Pasteur International Network. The RIIP Affiliate program strengthens exchanges and collaborations between researchers of the Network and those of the Institut Pasteur. see news.

 

 

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Phone: Email: Address 25-28 Rue du Docteur Roux 75015, Paris France Phone: Email: Address 25-28 Rue du Docteur Roux 75015, Paris France