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Événements

Training on the Agilent Bioanalyzer

Bâtiment: Biotop, 2ème etage – Salle: 2A – Address: 28 Rue du Docteur Roux, Paris, France
2017-05-10 10:00:00 2017-05-10 00:00:00 Europe/London Training on the Agilent Bioanalyzer The Transcriptome and Epigenome platform (PF2) offers training on the Agilent Bioanalyzer Wednesday, May 10 2017 from 10.00  to 12.00 am. (BioTop building, 2d floor, right, room 2.05. Warning: Lab coats must be worn […] 28 Rue du Docteur Roux, Paris, France

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Pushing the Limit: A Complete Solution for Generating Stranded RNA-Seq Libraries from Picogram Inputs of Total Mammalian RNA

With challenging samples, like RNA isolated using laser capture microscopy, it is difficult to obtain 10 ng of starting material; additionally, rRNA depletion leads to sample loss, undermining robust library preparation. The new release surpasses […]

Index compatibility for sequencing

Illumina uses a green laser to sequence G/T and a red laser to sequence A/C. At each cycle at least one of two nucleotides for each color channel need to be read to ensure […]

Protocol for library construction available allowing to perform RNAseq from low input

The SMARTer Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing – v3 incorporates Clontech’s patented SMART (Switching Mechanism at 5’ End of RNA Template) technology. This technology uses the template switching activity of reverse transcriptase […]

Single Cell

RNAseq is routinely used for the characterization of bulk transcriptome. Nevertheless, Interest in single-cell whole-transcriptome analysis is growing rapidly, especially for profiling rare or heterogeneous populations of cells. In collaboration with the Centre d’Immunologie […]

CHIPSeq

ChIPSeq is used for the analysis of the interactions between the genome and nucleic acids binding proteins like transcription factors or chromatin associated proteins. Starting from the IPs / inputs, the PF can perform […]

RNAseq

RNAseq is used for gene expression profiling of different populations of coding or non coding RNAs as well as for the annotation of the genome (exhaustive mapping of TSS, identification of splicing isoforms…). Several […]

Équipements

Sequencing Systems • Illumina • MiSeQ

Here is the list of type runs on MiSeq :List_runs_MiSeq 

BioAnalyzer • Agilent • Bioanalyzer 2100

Our Bioanalyzer 2100 is dedicated to the microfluidic  electrophoresis of nucleic acids (DNA, RNA). Depositing the samples is done on specific chips depending on the type of sample. Electrophoresis is fast and provided quantitative […]

Sequencing Systems • Illumina • HiSeq 2000

Illumina sequencing devices which are shared with other platforms of the Biomics Pole

Sequencing Systems • Illumina • Hiseq 2500 (1To)

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