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Présentation

Le Pôle Biomics est une structure appartenant au Centre de Ressources er Recherche Technologiques (C2RT) de l’Institut Pasteur. Cette structure est dédiée au séquençage de nouvelle génération et propose des technologies de séquençage long-read et short-read.

La mission du Pôle Biomics est de faciliter la découverte scientifique au sein du Réseau International des Institut Pasteur (RIIP). Biomics travaille aussi pour des équipes de recherche hors du RIIP et avec le secteur privé. Biomics accepte à la fois des projets de service et de collaboration et travaille en étroite collaboration avec le Centre de Bioinformatique, Biostatistique et Biologie Intégrative (C3BI) et la Direction des Systèmes d’Information (DSI) pour fournir des solutions d’analyse et de stockage de données pour les chercheurs.

Pour soumettre un projet cliquez ici

Pour tout renseignement sur les prix et délais d’exécution, veuillez nous contacter directement ici

Voici quelques exemples de ce que nous proposons:

    – Séquençage de novo et ciblé de virus, procaryotes et eucaryotes

    – Détection de variants (SNPs, indels, grands réarrangements)

    – Détection de SNPs chez l’homme et la souris par puces

    – Analyse transcriptionnelle (ARN-Seq) pour les procaryotes et les eucaryotes

    – Études métagénomiques par séquençage aléatoire ou ciblé (16S, ITS) à partir d’échantillons murins, humains et d’autres environnements

    – Épigénétique (études de méthylation)

    – Analyse PacBio à lecture longue pour l’ADN-Seq et la transcriptomique (Iso-Seq)

En plus des projets qui peuvent être réalisés directement au pôle Biomics, nous pouvons également fournir des contacts et de l’expertise pour d’autres technologies, y compris le séquençage du génome humain entier (Illumina / Chromium) ou Ion Proton/PGM.

Posez une question sur les techniques, nos services ou la technologie de séquençage

Les experts de Biomics travaillent de façon à assurer un traitement rapide et efficace de tous les échantillons et demandes. Si vous n’êtes pas satisfait de notre service ou si vous avez des suggestions d’améliorations, n’hésitez pas à nous contacter: Réclamation / Suggestions

Les groupes de recherche désireux d’inclure une activité importante de séquençage (production et analyse) dans une demande de financement sont invités à nous contacter avant la soumission: Inclure Biomics dans la demande de financement

 

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Services

Training on the Agilent Bioanalyzer

A SPOC for using the Agilent Bioanalyzer Training sessions for the use of the Bioanalyzer, organized at the Transcriptome and Epigenome platform of the Biomics pole, are now replaced by a SPOC, available 24 […]

Pushing the Limit: A Complete Solution for Generating Stranded RNA-Seq Libraries from Picogram Inputs of Total Mammalian RNA

With challenging samples, like RNA isolated using laser capture microscopy, it is difficult to obtain 10 ng of starting material; additionally, rRNA depletion leads to sample loss, undermining robust library preparation. The new release surpasses […]

Index compatibility for sequencing

Illumina uses a green laser to sequence G/T and a red laser to sequence A/C. At each cycle at least one of two nucleotides for each color channel need to be read to ensure […]

Protocol for library construction available allowing to perform RNAseq from low input

The SMARTer Ultra Low Input RNA Kit for Sequencing – v3 incorporates Clontech’s patented SMART (Switching Mechanism at 5’ End of RNA Template) technology. This technology uses the template switching activity of reverse transcriptase […]

Single Cell

RNAseq is routinely used for the characterization of bulk transcriptome. Nevertheless, Interest in single-cell whole-transcriptome analysis is growing rapidly, especially for profiling rare or heterogeneous populations of cells. In collaboration with the Centre d’Immunologie […]

CHIPSeq

ChIPSeq is used for the analysis of the interactions between the genome and nucleic acids binding proteins like transcription factors or chromatin associated proteins. Starting from the IPs / inputs, the PF can perform […]

RNAseq

RNAseq is used for gene expression profiling of different populations of coding or non coding RNAs as well as for the annotation of the genome (exhaustive mapping of TSS, identification of splicing isoforms…). Several […]

Équipements

Sequencing Systems • Illumina • MiSeQ

Here is the list of type runs on MiSeq :List_runs_MiSeq  

BioAnalyzer • Agilent • Bioanalyzer 2100

Our Bioanalyzer 2100 is dedicated to the microfluidic  electrophoresis of nucleic acids (DNA, RNA). Depositing the samples is done on specific chips depending on the type of sample. Electrophoresis is fast and provided quantitative […]

Sequencing Systems • Illumina • HiSeq 2000

Illumina sequencing devices which are shared with other platforms of the Biomics Pole

Sequencing Systems • Illumina • Hiseq 2500 (1To)

Illumina sequencing devices which are shared with other platforms of the Biomics Pole

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