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About

As a bioinformatics engineer, I completed my master degree in apprenticeship for two years at INRA in Jouy-en-Josas in the Genetic Animal department. I was involved in a project aiming at the detection and the expression analysis of micro-RNA involved in an equine disease.

In 2012, I joined the Genomic, Structure and Translation Team at Paris-Sud (Paris XI) university. I worked mainly on Ribosome Profiling data analysis, a new technique that allows to identify the position of the ribosome on the mRNA at the nucleotide level.

Since november 2015, I worked at Institut Pasteur. During 4 years, I was detached to the Biomics Platform, where I was in charge of the bioinformatics analyses for transcriptomics and epigenomics projects. I was also involved in Long Reads (PacBio and Nanopore) developments with other bioinformaticians of Biomics.

Since november 2019, I has joined the Hub of Bioinformatics and Biostatistics, et more precisely the Genome Organization Regulation and Expression group. I am involved in transcriptomics (differential analysis, RNA modification, assembly, etc..) and epigenomics projects (chromatin dynamics analysis using ChIP-seq and ATAC-seq), and in development of  snakemake based-pipelines for NGS analysis,  combining python, bash and R scripts.

Courses

12ème Ecole de bioinformatique AVIESAN – IFB – Inserm Niveau1 (2023)

Objectifs La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets “Next Generation Sequencing” (NGS). Cette édition de l’école aborde les nouveaux enjeux technologiques: elle s’articulera autour de trois ateliers thématiques en session […]

2023-11-05 18:00:00 2023-11-11 14:00:00 Europe/Paris 12ème Ecole de bioinformatique AVIESAN – IFB – Inserm Niveau1 (2023) Objectifs La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets “Next Generation Sequencing” (NGS). Cette édition de l’école aborde les nouveaux enjeux technologiques: elle s’articulera autour de trois ateliers thématiques en session […] Station Biologique de Roscoff, Place Georges Teissier, Roscoff, France Add to Calendar

2ème Ecole de Bioinformatique AVIESAN – IFB – INSERM Niveau 2

Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit Bulk RNA-seq, ChIP-seq/ATAC-seq, variants DNA-seq, niveau 2 Objectifs La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets “Next Generation […]

2023-06-05 08:00:00 2023-06-09 16:00:00 Europe/Paris 2ème Ecole de Bioinformatique AVIESAN – IFB – INSERM Niveau 2 Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit Bulk RNA-seq, ChIP-seq/ATAC-seq, variants DNA-seq, niveau 2 Objectifs La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets “Next Generation […] Station Biologique De Roscoff, Place Georges Teissier, Roscoff, France Add to Calendar

11ème école de bioinformatique AVIESAN-INSERM-IFB

Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit Bulk RNA-seq, ChIP-seq/ATAC-seq, variants DNA-seq, single-cell RNA-Seq, niveau 1 Objectifs La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets […]

2022-11-13 18:00:00 2022-11-18 13:00:00 Europe/Paris 11ème école de bioinformatique AVIESAN-INSERM-IFB Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit Bulk RNA-seq, ChIP-seq/ATAC-seq, variants DNA-seq, single-cell RNA-Seq, niveau 1 Objectifs La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets […] Station Biologique De Roscoff, Place Georges Teissier, Roscoff, France Add to Calendar

1ere école EBAII Assemblage & Annotation

Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit Assemblage et annotation de novo de génomes   Objectifs La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets “Next […]

2022-09-26 14:00:00 2022-09-30 14:00:00 Europe/Paris 1ere école EBAII Assemblage & Annotation Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit Assemblage et annotation de novo de génomes   Objectifs La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets “Next […] Station Biologique de Roscoff, Place Georges Teissier, Roscoff, France Add to Calendar

1ème Ecole de Bioinformatique AVIESAN – IFB – INSERM Niveau 2

Objectifs La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets “Next Generation Sequencing” (NGS). Cette édition de l’école aborde les nouveaux enjeux technologiques: elle s’articulera autour de trois ateliers thématiques en session […]

2021-05-25 09:00:00 2021-05-28 18:00:00 Europe/Paris 1ème Ecole de Bioinformatique AVIESAN – IFB – INSERM Niveau 2 Objectifs La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets “Next Generation Sequencing” (NGS). Cette édition de l’école aborde les nouveaux enjeux technologiques: elle s’articulera autour de trois ateliers thématiques en session […] Roscoff, France Add to Calendar

7ème école de bioinformatique AVIESAN-IFB

Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit   Objectifs La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets “Next Generation Sequencing” (NGS). Cette édition de l’école […]

2018-11-25 18:00:00 2018-11-30 16:00:00 Europe/Paris 7ème école de bioinformatique AVIESAN-IFB Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit   Objectifs La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets “Next Generation Sequencing” (NGS). Cette édition de l’école […] Station Biologique de Roscoff, Place Georges Teissier, Roscoff, France Add to Calendar

Hands-on course on High Throughput Sequencing data analysis: Genomics, Transcriptomics, Epigenomics

The University of Los Andes and the Hub of Bioinformatics and Biostatistics of the C3BI (Center of Bioinformatics Biostatistics and Integrative Biology) at Institut Pasteur will organize this Hands-on course aimed at students/researchers that […]

2017-11-27 09:00:00 2017-12-01 17:00:00 Europe/Paris Hands-on course on High Throughput Sequencing data analysis: Genomics, Transcriptomics, Epigenomics The University of Los Andes and the Hub of Bioinformatics and Biostatistics of the C3BI (Center of Bioinformatics Biostatistics and Integrative Biology) at Institut Pasteur will organize this Hands-on course aimed at students/researchers that […] Bogota - Bogotá, Colombie Add to Calendar

6ème école de bioinformatique AVIESAN-IFB

Objectifs La formation s’adresse à des chercheurs et ingénieurs directement impliqués dans des projets “Next Generation Sequencing” (NGS). Cette édition de l’école s’adresse aux nouveaux enjeux technologiques: elle inclura notamment une ouverture aux technologies […]

2017-11-12 18:00:00 2017-11-17 15:00:00 Europe/Paris 6ème école de bioinformatique AVIESAN-IFB Objectifs La formation s’adresse à des chercheurs et ingénieurs directement impliqués dans des projets “Next Generation Sequencing” (NGS). Cette édition de l’école s’adresse aux nouveaux enjeux technologiques: elle inclura notamment une ouverture aux technologies […] Station Biologique de Roscoff, Place Georges Teissier, Roscoff, France Add to Calendar

5ème école de bioinformatique AVIESAN-IFB

Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit Objectifs Les domaines des sciences du vivant liés à l’analyse du génome ont vu au cours des dernières années une accumulation […]

2016-11-20 17:00:00 2016-11-25 17:00:00 Europe/Paris 5ème école de bioinformatique AVIESAN-IFB Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit Objectifs Les domaines des sciences du vivant liés à l’analyse du génome ont vu au cours des dernières années une accumulation […] Station biologique de Roscoff, Place Georges Teissier, Roscoff, France Add to Calendar

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