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    Exemple : "division cellulaire"
  • Tip 2. Utilisez + afin de rendre obligatoire la présence d'un mot.
    Exemple : +cellule +stem
  • Tip 3. Utilisez + et - afin de forcer une inclusion ou exclusion d'un mot.
    Exemple : +cellule -stem
e.g. searching for members in projects tagged cancer
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Domaines Scientifiques
Maladies
Organismes
Applications
Technique
Date de Début
29
Jun 2015
Statut
En cours
Membres
2
Structures
1
Prix interne: free
Prix interne assisté: free

Présentation

Every Tuesday mornings from 10am to 12am, Hub engineers are enlisted to provide a direct support to any members of Institut Pasteur seeking help on bioinformatics or biostatistics related subjects. You can come directly to Yersin Building (24), Ground Floor, or if you work remotely you can also come virtually using Teams  .

Please note that open desks are suspended during Christmas & summer breaks.

If you need urgent help from the Hub at that time, please ask a short questions submitted through our web site or using the mail alias hub@pasteur.fr.

Hub engineers can provide support on :

  • Design of experiment (from the statistical point)
  • Analysis & integration of various types of data, including but not limited to :
    • OMICS data
    • epidemiological data
    • time series data
  • Statistics methods
  • Software development
  • Web tool development
  • Database development
  • Code review

Please use the following table to see available hub members for future sessions

Sessions Group Hub members
11-07-2023
12-12-2023
23-04-2024
Group 1 Rachel Torchet – Web & software development, User experience
Stevenn Volant – Statistics, Metagenomics, Rshiny
Thomas Bigot – Phylogenetics, Software development & Algorithmics
Damien Mornico – Genomics, Paleogenomics
18-07-2023
19-12-2023
30-04-2024
Group 2 Rémi Planel – Web development, Database management
Vincent Guillemot – Statistics
Julien Gugluielmini – Phylogenetics, Genomics
Amaury Vaysse – Genomics, R
25-07-2023
09-01-2024
07-05-2024
Group 3 Nicolas Maillet – Algorithmics, Software development, Metagenomics, Stringology
Thomas Obadia – Statistics, Epidemiology
Nathalie Lehmann
Frédéric Lemoine – Phylogenetics, Software development, Transcriptomics
05-09-2023
16-01-2024
14-05-2024
Group 4 Simon Malesys – Web & Software development, Data integration & management
Hugo Varet – Statistics, R, Metabolomics
Anna Zhukova – Phylogenetics, Software development, Network analysis
Rachel Legendre – Transcriptomics, Epigenomics
For 14-05-2024 session : Simon Maleysys will be replaced by Elodie Chapeaublanc
12-09-2023
23-01-2024
21-05-2024
Group 5 Johann Dreo – Software development, Decision support systems, Network analysis
Hanna Julienne – Statistics, Development, Genomics
Emmanuelle Permal – Genomics, Development, Transcriptomics
Samar Berreira Ibraim
19-09-2023
30-01-2024
28-05-2024
Group 6 Bryan Brancotte – Web development, Database management
Quentin Giai Gianetto – Statistics, Proteomics
Daniele Capocefalo  – Transcriptomics, Single cell, Multidimensional analysis
Hélène Lopez-Maestre – Genomics, Transcriptomics, Single Cell
26-09-2023
06-02-2024
04-06-2024
Group 7 Blaise Li – Software development, Automation, Reproducibility, Python, command-line
Pascal Campagne – Statistics, Genomics, GWAS
Najwa Taib – Phylogenetics
Natalia Pietrosemoli – Systems bioinformatics, Transcriptomics, Proteomics, Metabolomics
03-10-2023
13-02-2024
11-06-2024
Group 8 Fabien Mareuil – Web Development, Galaxy, Structural bioinformatics
Emeline Perthame – Statistics, Transcriptomics, Proteomics
Adrien Pain – Genomics, Transcriptomics
Claudia Chica – Transcriptomics, Epigenomics, Single cell
10-10-2023
20-02-2024
18-06-2024
Group 9 Bertrand Néron – Algorithmics, Software development, Database management
Elise Jacquemet – Statistics, Transcriptomics
Stéphane Descorps-Declère – Algorithmics, Software development, Genomics
Eva Eleftheriou – Epigenomics, Transcriptomics
17-10-2023
27-02-2024
25-06-2024
Group 10 Thomas Cokelaer – Algorithmics, Genomics, Transcriptomics
Gaël Millot – Statistics, Genomics, Image analysis
Bernd Jagla – Single cell, Cytometry data analysis, Transcriptomics
Nicolas Traut – Neuroimaging, Genomics
24-10-2023
05-03-2024
02-07-2024
Group 11 Elodie Chapeaublanc – Web development, Database management
Anđela Davidović – System biology, Mathematical modeling
Kevin Da Silva
Yann loe-Mie – Genomics, Transcriptomics, Epigenomics, Single cell
31-10-2023
12-03-2024
09-07-2024
Group 12 Pierre Lechat – Software development, Variant calling
François Laurent – Software development, Modelisation, Statistics
Olivier Mirabeau – Transcriptomics, Genomics, Statistics
Maguelonne Roux – Genomics
07-11-2023
19-03-2024
16-07-2024
Group 13 Yoann Dufresne – Algorithmic, Pipeline development, Genomics
Juliette Meyer – Statistics
Sébastien Mella – Single Cell, Statistics
Violaine Saint-André – Epigenomics, Transcriptomics
14-11-2023
26-03-2024
23-07-2024
Group 14 Jeliyah Clark
Benoît Lelandais – Image analysis, Software development, Artificial Intelligence
Julien Fumey – Genomics, Phylogenetics
Rania Ouazahrou
21-11-2023
02-04-2024
Group 15 Julia Kende – Phylogenetics, Software development & Algorithmics
Vincent Laville – Statistics, Development, Genomics
IR GC
Victoire Baillet – Genomics, Epigenomics
28-11-2023
09-04-2024
Group 16 Juliette Bonche – UI/UX Design, Web development
Arnaud Meng  -Single Cell, Transcriptomics, Mass spectometry, pipeline Development
Etienne Kornobis – Software development, Transcriptomics, Genomics
Corinne Maufrais – Genomics, Data management
05-12-2023
16-04-2024
Group 17 Amandine Perrin – Software development, Comparative genomics
Mickael Orgeur
Artem Baidaliuk
Stephan Fischer – Single Cell, Genomics

Protocole d'accès

  • Every Tuesday morning
  • From 10 to 12
  • Yersin Building (24), Ground Floor
  • On Teams using this link
  • Short term assistance, first contact