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Présentation

Après un diplôme d’ingénieur agronome (Agrocampus Ouest, Rennes, France), Thomas a obtenu une thèse de Doctorat en biostatistiques de l’Université Université Pierre et Marie Curie. Sa thèse portait sur la contribution des réseaux de contacts à la compréhension de la dissémination des infections nosocomiales.

Au cours de sa thèse, il a étudié comment des données de contacts à haute résolution pouvaient contribuer au suivi de la transmission de bactéries nosocomiales, en complément de la surveillance plus traditionnellement effectuée (comme des prélèvements réguliers par écouvillonnages des patients et du personnel de santé, et un génotypage des souches identifiées). Il a proposé une nouvelle méthode pour tester la corrélation entre les réseaux dynamiques d’interactions de proximité et des données issues de microbiologie.

Thomas est également auteur du package R0 pour le logiciel R. Ce package implémente de façon standardisée plusieurs méthodes pour quantifier les paramètres de reproduction d’une maladie émergente.

Après avoir travaillé comme modélisateur dans une société privée de conseil à l’industrie pharmaceutique, il a rejoint le Hub en 2016 en qualité de statisticien. Il est maintenant impliqué dans les projets de l’unité de recherche Malaria: parasites et hôtes dirigée par Ivo Mueller.

Cours

Bioinformatics program for PhD students 2023 2024

This training program in statistics, bioinformatics and image analysis, financed by INCEPTION program, begins with a mandatory common core during which we will present all the tracks, and follow short courses on computer science, […]

2023-10-23 09:30:00 2024-06-28 17:00:00 Europe/Paris Bioinformatics program for PhD students 2023 2024 This training program in statistics, bioinformatics and image analysis, financed by INCEPTION program, begins with a mandatory common core during which we will present all the tracks, and follow short courses on computer science, […] 25-28 Rue du Docteur Roux, Paris, France

Bioinformatics program for PhD students 2022-2023

This training program in statistics, bioinformatics and image analysis begins with a mandatory common core during which we will present all the tracks, and follow short courses on computer science, reproducible research, experimental design […]

2022-10-21 09:30:00 2023-06-30 18:00:00 Europe/Paris Bioinformatics program for PhD students 2022-2023 This training program in statistics, bioinformatics and image analysis begins with a mandatory common core during which we will present all the tracks, and follow short courses on computer science, reproducible research, experimental design […] 25-28 Rue du Docteur Roux, Paris, France

Projets

CV

Professional experience

June 2016 – current – Institut Pasteur – Research engineer

Hub Team & Malaria: parasites and hosts research unit.

October 2015 – May 2016 – LASER Analytica – Statistical modeler

Evidence generation for health economics and outcomes research.

October 2012 – September 2015 – Inserm – Ph.D. candidate

Use of high-resolution contact network to inform on S. aureus transmission paths in hospital.

October 2011 – September 2012 – Inserm – Engineer

Development of the R0 package and statistical analysis of clinical data.

Education

 

2012 – 2015 – Université Pierre et Marie Curie – Paris 6 – Ph.D. candidate

2010 – 2011 – Université Rennes 1 – Masters in modelling applied to environmental and biological sciences.

2008 – 2011 – Agrocampus Ouest – Engineer in Agronomy (specialization in modelling of biological sciences)

Publications

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