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Présentation

Je suis ingénieur de recherche en bioinformatique et je développe des outils de visualisation et d’intégration de données. Je combine plusieurs langages de programmation impliqués dans le développement web.

J’ai suivi une formation complète en bioinformatique avec l’option génie biologique. Grâce à un DUT, une licence et un master, j’ai acquis de solides connaissances dans plusieurs langages de programmation et de méthodologie en bioinformatique ainsi qu’en biologie. Ma formation comprenait différents stages au cours desquels j’ai développé des outils bioinformatiques en fonction des besoins de chaque laboratoire.

En 2009, j’ai rejoint l’équipe d’Oncologie Moléculaire dirigée par le Pr. François Radvanyi à l’Institut Curie Paris où j’étais en charge de la gestion et du stockage des données générées par les biologistes, faisant des analyses dans différents domaines Omics tels que la transcriptomique, la génomique, les variations du nombre de copies, et la méthylation. J’ai également développé plusieurs applications web et applications Rshiny pour aider les biologistes à visualiser et partager les données omiques, mais aussi à gérer certains réactifs utilisés lors des expériences.

En octobre 2022, j’ai rejoint le groupe d’intégration Web – WINTER –  au sein du HUB de Bioinformatique et Biostatistique.

CV

Expériences professionnelles

  • 2009
    Ingénieur en BioinformatiqueMolecular Oncology Team – Institut Curie – Paris
  • Développement de plusieurs outils bioinformatiques pour aider les biologistes à visualiser les données omiques ou à gérer certains réactifs utilisés dans les expériences.
    Analyser différentes données omiques telles que la transcriptomique, la génomique, les variations du nombre de copies et la méthylation.
    Gérer toutes les données générées par l’équipe (omiques, données de séquençage et métadonnées) et les données publiques.
    Enseigner les bonnes pratiques de programmation et le langage R aux biologistes.
  • 2007
    Stage Master 2 – Ingénieur en Bioinformatique Unité de Recherche en Biologie et Epidémiologie Parasitaires – Institut de Médecine Tropicale du Service de Santé des Armées – Marseille
  • Développement d’applications Web pour aider les biologistes à interpréter la séparation des protéines par électrophorèse couplée à la spectrométrie de masse afin d’identifier les protéines d’intérêt présentes dans les échantillons (glande salivaire de moustiques impliqués dans le paludisme (Anopheles gambiae et Aedes aegypti) et érythrocytes humains infectés par Plasmodium falciparum avec ou sans traitement à la doxycycline).
  • Analyse de données transcriptomiques

Diplômes

  • 2007
    Master 2 Degree in Bioinformatic
    UFR des Sciences et Techniques – Nantes
  • 2006
    Maitrise in Bioinformatic
    UFR des Sciences et Techniques – Nantes
  • 2005
    Licence “Biotechnologies et Bio-industries” “Spécialité Génie Biologique et Informatique”
    Université du Val d’Essonne – Evry
  • 2005
    D.U.T. “Génie Biologique Option BioInformatique”
    I.U.T d’Auvergne Université de Clermont Ferrand – Aurillac

Publications

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