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Personnel Administratif
Chargé(e) de Recherche Expert
Directeur(trice) de Recherche
Assistant(e) de Recherche Clinique
Chercheur(euse) Clinicien(ne)
Manager de département
Professeur(e)
Etudiant(e) M2
Professeur Honoraire
Aide technique
Chercheur(euse) Contractuel(le)
Chercheur(euse) Permanent(e)
Pharmacien(ne)
Etudiant(e) en thèse
Médecin
Post-doctorant(e)
Chef(fe) de Projet
Chargé(e) de Recherche
Ingénieur(e) de Recherche
Chercheur(euse) Retraité(e)
Technicien(ne)
Etudiant(e)
Vétérinaire
Visiteur(euse) Scientifique

Appointments

Directeur(trice) Adjoint(e) de Centre
Directeur(trice) Adjoint(e) de Départment
Directeur(trice) Adjoint(e) de Centre National de Référence
Directeur(trice) Adjoint(e) de Plateforme
Directeur(trice) de Centre
Directeur(trice) de Départment
Directeur(trice) d'Institut
Directeur(trice) de Centre National de Référence
Chef(fe) de Groupe
Responsable de Plateforme
Responsable opérationnel et administratif
Responsable de Structure
Président(e) d'honneur de Département
Coordinateur(trice) du Labex

Type of team

Laboratory
UMR
UTechS
Junior Group (G5)
Technological Pole
Platform
Collection
Group

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Personnel Administratif
Chargé(e) de Recherche Expert
Directeur(trice) de Recherche
Assistant(e) de Recherche Clinique
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Etudiant(e) M2
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Paul-Henri Consigny

© Recherche

Membre: Ingénieur(e) de Recherche

Gaël Millot

• Hub de Bioinformatique et Biostatistique • Groupe d’expertise : Génomique

Plateforme: Hub de Bioinformatique et Biostatistique

Groupe: Groupe d’expertise : Génomique

PM

Domaines Scientifiques

Maladies

Organismes

Applications

Technique

Domaines Scientifiques

Cancer biology
DNA repair
Genetics
Recombination
Replication

Maladies

Breast cancer
Ovarian cancer
Retinoblastoma

Organismes et Organes

Human
Yeast

Technique

Data visualization tools
Image analysis
Sequencing
Statistical inference
Variant detection

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39 Publications

Cours

Introduction to data analysis

This five weeks graduate level course will give participants basic skills and hands-on training in biostatistics. It will cover all the steps of an analysis workflow : design, collection, curation, hypothesis testing and data […]

Hub de Bioinformatique et Biostatistique

Stéphane Descorps Declere

Marie-Agnès Dillies

Quentin Giai Gianetto

Vincent Guillemot

Nicolas Maillet

Amandine Perrin

2017-01-16 09:00:00 2017-02-17 13:00:00 Europe/Paris Introduction to data analysis This five weeks graduate level course will give participants basic skills and hands-on training in biostatistics. It will cover all the steps of an analysis workflow : design, collection, curation, hypothesis testing and data […] 28 Rue du Docteur Roux, Paris, France

Introduction to Data Analysis

This four-week graduate level course will give participants basic skills and hands-on training in statistics and descriptive data analysis. This course is (primarily) dedicated to first year PhD students of the Institut Pasteur (each […]

Hub de Bioinformatique et Biostatistique

INCEPTION – INstitut Convergences pour l’étude de l’Émergence des Pathologies au Travers des Individus et des populatiONs

Marie-Agnès Dillies

Stéphane Descorps Declere

Vincent Guillemot

Emeline Perthame

Quentin Giai Gianetto

2017-10-16 09:00:00 2017-11-17 12:00:00 Europe/Paris Introduction to Data Analysis This four-week graduate level course will give participants basic skills and hands-on training in statistics and descriptive data analysis. This course is (primarily) dedicated to first year PhD students of the Institut Pasteur (each […] 28 Rue du Docteur Roux, Paris, France

Introduction to Data Analysis

This four-week graduate level course will give participants basic skills and hands-on training in statistics and descriptive data analysis. This course is (primarily) dedicated to first year PhD students of the Institut Pasteur (each […]

Hub de Bioinformatique et Biostatistique

Marie-Agnès Dillies

Vincent Guillemot

Emeline Perthame

Quentin Giai Gianetto

Christophe Becavin

Violaine Saint-André

2018-10-22 09:00:00 2018-11-20 00:00:00 Europe/Paris Introduction to Data Analysis This four-week graduate level course will give participants basic skills and hands-on training in statistics and descriptive data analysis. This course is (primarily) dedicated to first year PhD students of the Institut Pasteur (each […] 28 Rue du Dr Roux, Paris, France

Introduction to Data Analysis

This four-week graduate level course will give participants basic skills and hands-on training in statistics and descriptive data analysis. This course is (primarily) dedicated to first year PhD students of the Institut Pasteur (each […]

Hub de Bioinformatique et Biostatistique

INCEPTION – INstitut Convergences pour l’étude de l’Émergence des Pathologies au Travers des Individus et des populatiONs

Marie-Agnès Dillies

Stéphane Descorps Declere

Vincent Guillemot

Emeline Perthame

Quentin Giai Gianetto

Christophe Becavin

2018-01-08 09:00:00 2018-02-02 00:00:00 Europe/Paris Introduction to Data Analysis This four-week graduate level course will give participants basic skills and hands-on training in statistics and descriptive data analysis. This course is (primarily) dedicated to first year PhD students of the Institut Pasteur (each […] 28 Rue du Docteur Roux, Paris, France

Logiciel

Serpentine: a flexible 2D binning method for differential Hi-C analysis

Romain Koszul (PI)

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7320618/ Motivation: Hi-C contact maps reflect the relative contact frequencies between pairs of genomic loci, quantified through deep sequencing. Differential analyses of these maps enable downstream biological interpretations. However, the multi-fractal nature of the […]

Outils

Linkage Analysis Using TARS

Gaël Millot (PI)

Integrated bash and R toolbox for linkage analysis using SLURM (TARS Cluster) that include (1) basic quality control of initial file structures, (2) quality control analysis and file preparation by the Alohomora software and […]

Cute Little Functions

Gaël Millot (PI)

Cute Little Functions contains 16 functions for R/RStudio that facilitate basic procedures in 1) object analysis, 2) object modification, 3) graphic handling and 4) log file management.

Comat

Gaël Millot (PI)

Comat is a R toolbox that provides quality control reports, matrix distances, permutation test, corrected p values and graphics for the 2 by 2 comparison of contingency matrices of same dimension in batches.

CV

Professional experiences
2016 – presentResearch Engineer, Institut Pasteur
2005 – 2016Associate Professor (Maître de Conférences), UPMC & Institut Curie
2003 – 2004Associate Professor, UPMC & Institut Jacques Monod
2001 – 2003Assistant Professor (ATER), UPMC & Institut Jacques Monod

Education
2013Research Leader grade (HDR), Université Pierre et Marie Curie (UPMC, Paris VI)
2001PhD in Human Genetics, Université Paris VII & Institut Gustave Roussy
1995DEA Genetic ressources and plant improvement, Université Paris XI
1994Magistère de Génétique, Université Paris VII

Publications

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2021

Marbouty M, Thierry A, Millot GA, Koszul R, , MetaHiC phage-bacteria infection network reveals active cycling phages of the healthy human gut., Elife 2021 Feb; 10(): .
2020

Menegatti S, Guillemot V, Latis E, Yahia-Cherbal H, Mittermüller D, Rouilly V, Mascia E, Rosine N, Koturan S, Millot GA, Leloup C, Duffy D, Gleizes A, Hacein-Bey-Abina S, , Sellam J, Berenbaum F, Miceli-Richard C, Dougados M, Bianchi E, Rogge L, , Immune response profiling of patients with spondyloarthritis reveals signalling networks mediating TNF-blocker function in vivo., Ann Rheum Dis 2020 Dec; (): .
2020

Baudry L, Millot GA, Thierry A, Koszul R, Scolari VF, , Serpentine: a flexible 2D binning method for differential Hi-C analysis., Bioinformatics 2020 Jun; 36(12): 3645-3651.
2020

Gérard A, Woolfe A, Mottet G, Reichen M, Castrillon C, Menrath V, Ellouze S, Poitou A, Doineau R, Briseno-Roa L, Canales-Herrerias P, Mary P, Rose G, Ortega C, Delincé M, Essono S, Jia B, Iannascoli B, Richard-Le Goff O, Kumar R, Stewart SN, Pousse Y, Shen B, Grosselin K, Saudemont B, Sautel-Caillé A, Godina A, McNamara S, Eyer K, Millot GA, Baudry J, England P, Nizak C, Jensen A, Griffiths AD, Bruhns P, Brenan C, High-throughput single-cell activity-based screening and sequencing of antibodies using droplet microfluidics, Nat. Biotechnol. 2020 Mar;.
2020

Monteiro AN, Bouwman P, Kousholt AN, Eccles DM, Millot GA, Masson JY, Schmidt MK, Sharan SK, Scully R, Wiesmüller L, Couch F, Vreeswijk MPG, Variants of uncertain clinical significance in hereditary breast and ovarian cancer genes: best practices in functional analysis for clinical annotation, J. Med. Genet. 2020 Mar;.
2020

Balbino B, Herviou P, Godon O, Stackowicz J, Goff OR, Iannascoli B, Sterlin D, Brûlé S, Millot GA, Harris FM, Voronina VA, Nadeau KC, Macdonald LE, Murphy AJ, Bruhns P, Reber LL, The anti-IgE mAb omalizumab induces adverse reactions by engaging Fcγ receptors, J. Clin. Invest. 2020 Mar;130(3):1330-1335.
2019

Sanchez David RY, Combredet C, Najburg V, Millot GA, Beauclair G, Schwikowski B, Léger T, Camadro JM, Jacob Y, Bellalou J, Jouvenet N, Tangy F, Komarova AV, , LGP2 binds to PACT to regulate RIG-I- and MDA5-mediated antiviral responses., Sci Signal 2019 10; 12(601): .
2019

Chaussade A, Millot G, Wells C, Brisse H, Laé M, Savignoni A, Desjardins L, Dendale R, Doz F, Aerts I, Jimenez I, Cassoux N, Stoppa Lyonnet D, Gauthier Villars M, Houdayer C, Correlation between RB1germline mutations and second primary malignancies in hereditary retinoblastoma patients treated with external beam radiotherapy, Eur J Med Genet 2019 Mar;62(3):217-223.
2019

Blin M, Le Tallec B, Nähse V, Schmidt M, Brossas C, Millot GA, Prioleau MN, Debatisse M, Transcription-dependent regulation of replication dynamics modulates genome stability, Nat. Struct. Mol. Biol. 2019 01;26(1):58-66.
2018

Cossé MM, Barta ML, Fisher DJ, Oesterlin LK, Niragire B, Perrinet S, Millot GA, Hefty PS, Subtil A, The Loss of Expression of a Single Type 3 Effector (CT622) Strongly Reduces Infectivity and Growth, Front Cell Infect Microbiol 2018;8:145.
+

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Publié le: 22 Nov 2016 • Modifié le: 18 Jun 2021

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Coordinated by Nathalie de Parseval

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Scientific General Secretary of Institut Pasteur.

Designed by Yhello

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Yhello is a digital creation agency based in Paris, created by former scientists passionate about the web.

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