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Présentation

Le groupe Systems Bioinformatics (SysBio) intègre des approches de biologie des systèmes afin de caractériser des interactions biologiques complexes d’un point de vue holistique. Notre équipe apporte à la communauté scientifique de l’Institut Pasteur (IP), une expertise bioinformatique de haut niveau pour l’analyse de données “multi-omiques” de grande ampleur, provenant de différentes technologies “haut débit” (i.e. génomiques, transcriptomiques, protéomiques et métabolomiques). Nos méthodes et pipelines permettent d’aborder des schémas expérimentaux complexes, intégrant de nombreuses technologies, échantillons, donneurs, points de control, protocols ou traitements

Cette approche offre des opportunités inédites pour déchiffrer les mécanismes moléculaires des systèmes biologiques, aidant les scientifiques à détecter des liens genotype-phenotype complexes à différents niveaux. Ce qui nécessite, toutefois, le développement d’outils bioinformatiques et statistiques robustes pour l’intégration de divers types de données, chacune caractérisée par sa propre source de bruit technique ou biologique.

A l’intersection entre la biologie systémique et la bioinformatique, nos principaux domaines d’expertise incluent :

  • théorie des graph et des réseaux
  • inférence statistique
  • modèles probabilistes

En plus de ces services et activités de recherche, nous sommes fortement impliqués dans la diffusion des connaissances en bioinformatique et biostatistiques, au travers, notamment, de l’organisation des séminaires du Département de Biologie Computationelle ou de conférences internationales, et la réalisation d’enseignements pour les PhD et pour les Réseaux Internationaux de l’Institut Pasteur (RIIP).

Quelques réunions précédentes :

From gene expression to regulation networks (24.09.2020)

Cours

Introduction à l’analyse Bio-informatique de séquences

L’objectif de cette formation est de présenter, au travers de l’utilisation d’outils largement utilisés, quelques grands principes sur l’analyse de séquence. L’ensemble de la formation combine exposés théoriques (fondements méthodologiques des programmes) et applications […]

2019-09-23 09:00:00 2019-09-27 17:00:00 Europe/Paris Introduction à l’analyse Bio-informatique de séquences L’objectif de cette formation est de présenter, au travers de l’utilisation d’outils largement utilisés, quelques grands principes sur l’analyse de séquence. L’ensemble de la formation combine exposés théoriques (fondements méthodologiques des programmes) et applications […] Institut Pasteur, Rue du Docteur Roux, Paris, France

Analyse de séquences

OBJECTIFS : Les biologistes sont régulièrement confrontés à des gènes (ou des protéines) de fonctions inconnues ou mal annotés. Dans ce contexte, maîtriser quelques techniques basiques d’analyse de séquences peut se révéler d’une aide […]

2018-03-19 09:30:00 2018-09-23 17:00:00 Europe/Paris Analyse de séquences OBJECTIFS : Les biologistes sont régulièrement confrontés à des gènes (ou des protéines) de fonctions inconnues ou mal annotés. Dans ce contexte, maîtriser quelques techniques basiques d’analyse de séquences peut se révéler d’une aide […] Institut Pasteur, Rue du Docteur Roux, Paris, France

5ème école de bioinformatique AVIESAN-IFB

Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit Objectifs Les domaines des sciences du vivant liés à l’analyse du génome ont vu au cours des dernières années une accumulation […]

2016-11-20 17:00:00 2016-11-25 17:00:00 Europe/Paris 5ème école de bioinformatique AVIESAN-IFB Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit Objectifs Les domaines des sciences du vivant liés à l’analyse du génome ont vu au cours des dernières années une accumulation […] Station biologique de Roscoff, Place Georges Teissier, Roscoff, France

Projets

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SysBio - Bio-informatique des Systèmes

This course, organized and tought by FunGen, was designed upon request of the Institut Pasteur to offer a yearly training presenting the main principles of sequence analysis through the use of speciliased web sites. It provides both ground theoretical basis and practical criteria allowing the students to use sequences analysis tools.