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Since September 2016, I am a research engineer in the Bioinformatics and Biostatistics HUB of the Institut Pasteur and detached in the Proteomics facility.

I have a PhD in Signal Processing from the Ecole Nationale Supérieure des Télécommunications de Bretagne (Telecom Bretagne (now IMT Atlantique)) and a Master in Mathematics with a specialty in Statistical Engineering from Rennes 1 University.

Today, most of the projects I work on consist of detecting changes in protein abundances using discovery-driven mass spectrometry. I am interested in the development of new methodologies to optimize proteomics data analysis pipelines, from the identification of peptides/proteins to their quantification and the interpretation of results. For this purpose, I worked on several R packages which can be downloaded from the CRAN and Bioconductor:

 

R Tutorials:

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Stevenn Volant
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Hugo Varet
Hanna Julienne
Violaine Saint-André
Julien Guglielmini
Thomas Bigot
Quentin Giai Gianetto
Claudia Chica
Rachel Legendre
Adrien Pain
Natalia Pietrosemoli
Emeline Perthame
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Benoît Lelandais
Dmitry Ershov
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2020-10-15 09:30:00 2021-06-03 17:00:00 Europe/Paris Bioinformatics program for PhD students 2020-2021 This mandatory training program, required for all Institut Pasteur PhD students, begins with a group of common core courses including a knowledge base in reproducible research, R Programming and Statistics. Each student then can […] 25-28 Rue du Dr Roux, 75015 Paris, France
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Marie-Agnès Dillies
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Quentin Giai Gianetto
Vincent Guillemot
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Bertrand Neron
2017-01-16 09:00:00 2017-02-17 13:00:00 Europe/Paris Introduction to data analysis This five weeks graduate level course will give participants basic skills and hands-on training in biostatistics. It will cover all the steps of an analysis workflow : design, collection, curation, hypothesis testing and data […] 28 Rue du Docteur Roux, Paris, France
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Introduction to Data Analysis

This four-week graduate level course will give participants basic skills and hands-on training in statistics and descriptive data analysis. This course is (primarily) dedicated to first year PhD students of the Institut Pasteur (each […]
Hub de Bioinformatique et Biostatistique
Marie-Agnès Dillies
Vincent Guillemot
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Hugo Varet
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2018-10-22 09:00:00 2018-11-20 00:00:00 Europe/Paris Introduction to Data Analysis This four-week graduate level course will give participants basic skills and hands-on training in statistics and descriptive data analysis. This course is (primarily) dedicated to first year PhD students of the Institut Pasteur (each […] 28 Rue du Dr Roux, Paris, France
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