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Cours

09:30
15
Oct 2020
Cours

Bioinformatics program for PhD students 2020-2021

This mandatory training program, required for all Institut Pasteur PhD students, begins with a group of common core courses including a knowledge base in reproducible research, R Programming and Statistics. Each student then can […]
Hub d’Analyse d’Images
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2020-10-15 09:30:00 2021-06-03 17:00:00 Europe/Paris Bioinformatics program for PhD students 2020-2021 This mandatory training program, required for all Institut Pasteur PhD students, begins with a group of common core courses including a knowledge base in reproducible research, R Programming and Statistics. Each student then can […] 25-28 Rue du Dr Roux, 75015 Paris, France
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12
Sep 2019
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Introduction to Application development in Shiny

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2019-09-12 10:00:00 2019-09-13 18:00:00 Europe/Paris Introduction to Application development in Shiny L’Institut Français de Bioinformatique organise en partenariat avec le SIB (Swiss Institute of Bioinformatics) une formation au package R-Shiny les 9 et 10 juillet 2019 à l’I. Pasteur (Paris). L’objectif de la formation est […] 25-28 Rue du Dr Roux, 75015 Paris, France

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Oncobiomics – THE (heterogenity tumor ecosystem)

Marc Monot (PI)

The Oncobiomics project is conducted in the HTE (heterogenity tumor ecosystem) national program launched by the cancer nation institute (Inca) in the third national cancer plan 2014-2019. It’s a consortium project involving 8 teams […]
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Protected: Pasteur Human Genome

Thomas Bourgeron (PI)

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A personal database system for large scale quantitative results exploration (Cassandre, PTR 463)

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Cassandre is a project of personal database system, integrating a “user-friendly” interface to manage and explore multiple sets of large-scale experimental results in biology. Large-scale experiments that generate quantitative data, such as changes in […]
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Diversity and stability of eukaryotic transcripts

Alain Jacquier (PI)

We focus on RNA quality control mechanisms and their consequences for the cells. Our previous studies revealed, for example, unexpected properties of the transcription process, such as its high pervasiveness and the intrinsic bi-directionality […]
Projet
En cours
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Genome-wide genetic screens by GIM (Genetic Interactions Mapping)

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To explore the effects of combining mutations and thus, be able to better understand complex functional interactions in a cell, we developed a novel genetic screening method that combines the exhaustivity of the yeast […]

Logiciel

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En cours
2 Membres

Counter RNAseq Window (CRAW)

Bertrand Neron (PI)

CRAW is a package which aim to compute and visualize the coverage of RNA seq experiments. The main feature of this tools is the coverage is computed on the both strands, and is centred […]
Logiciel
En cours
8 Membres

SHAMAN: SHiny Application for Metagenomic ANalysis

Amine Ghozlane (PI)

SHAMAN is a SHiny Application for Metagenomic ANalysis including the normalization, the differential analysis and mutiple visualization. SHAMAN is based on DESeq2 R package [Anders and Huber 2010] for the analysis of metagenomic data, […]

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