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Cours

Introduction à l’analyse Bio-informatique de séquences

L’objectif de cette formation est de présenter, au travers de l’utilisation d’outils largement utilisés, quelques grands principes sur l’analyse de séquence. L’ensemble de la formation combine exposés théoriques (fondements méthodologiques des programmes) et applications […]

2019-09-23 09:00:00 2019-09-27 17:00:00 Europe/Paris Introduction à l’analyse Bio-informatique de séquences L’objectif de cette formation est de présenter, au travers de l’utilisation d’outils largement utilisés, quelques grands principes sur l’analyse de séquence. L’ensemble de la formation combine exposés théoriques (fondements méthodologiques des programmes) et applications […] Institut Pasteur, Rue du Docteur Roux, Paris, France

Analyse de séquences

OBJECTIFS : Les biologistes sont régulièrement confrontés à des gènes (ou des protéines) de fonctions inconnues ou mal annotés. Dans ce contexte, maîtriser quelques techniques basiques d’analyse de séquences peut se révéler d’une aide […]

2018-03-19 09:30:00 2018-09-23 17:00:00 Europe/Paris Analyse de séquences OBJECTIFS : Les biologistes sont régulièrement confrontés à des gènes (ou des protéines) de fonctions inconnues ou mal annotés. Dans ce contexte, maîtriser quelques techniques basiques d’analyse de séquences peut se révéler d’une aide […] Institut Pasteur, Rue du Docteur Roux, Paris, France

5ème école de bioinformatique AVIESAN-IFB

Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit Objectifs Les domaines des sciences du vivant liés à l’analyse du génome ont vu au cours des dernières années une accumulation […]

2016-11-20 17:00:00 2016-11-25 17:00:00 Europe/Paris 5ème école de bioinformatique AVIESAN-IFB Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit Objectifs Les domaines des sciences du vivant liés à l’analyse du génome ont vu au cours des dernières années une accumulation […] Station biologique de Roscoff, Place Georges Teissier, Roscoff, France

CV

Professional Experience

Since October 2014 – Institut Pasteur – HUB Team

2011 – 2014 – CEA – GenoScope – LABGeM (Evry)

Databases and interfaces development for metabolic network curation in the european MICROME project.

2009 – 2010 – IRD – Laboratoire d’étude des symbioses tropicales et méditerranéennes (Montpellier)

Comparative genomics of 9 Aeschyomene symiont strains from the Bradyrhizobium genus : Comparison of the genomic sequences, Core and Pan genome identification, Study of the potential genomic island distribution, Metabolic network comparison.

2008 – 2009 – CEA – GenoScope – LABGeM (Evry)

Setup of a pipeline for Metabolic network reconstruction, database design and web interfaces development in the MicroScope bacterial analysis platform. Metabolic comparison within the Carnoules metagenomics analysis.

 

Education

2007 – MSc : Structural Genomics and Bioinformatics – Université L.Pasteur (Strasbourg)

2005 – BSc : Biology – Univeristé H.Poincarré (Nancy)

 

Publications

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