Le groupe WINTER est une équipe de développement logiciel axé principalement sur les technologies Web pour la publication et le partage d’outils, d’analyses, de données et de workflows scientifiques. Nous fournissons notre expertise aux scientifiques du campus, couvrant un large éventail de services pour concevoir, développer et publier des outils logiciels et des bases de données sur le Web. Nos projets couvrent une grande variété de domaines scientifiques (Bioinformatique Structurale, Transcriptomique, Génétique Statistique, etc.). De plus, nous sommes responsables du serveur Galaxy de l’Institut Pasteur, une plateforme d’intégration pour publier et utiliser des outils et des workflows de bioinformatique via une interface web. Enfin, notre groupe est très impliqués dans des collaborations, notamment avec l’Institut Français de Bioinformatique (par ex. via la participation à l’environnement distribué national de services en Bioinformatique) et l’infrastructure européenne ELIXIR (par ex. via la participation au programme EXCELERATE).
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Connexions
Membres

Elodie Chapeaublanc
Ingénieur(e) de Recherche
Responsable
Anciens Membres
2000
2000
Name
Position
2018
2020
Olivia Doppelt-Azeroual
Research Engineer
2018
2020
Kenzo-Hugo Hillion
Research Engineer
2018
2020
Jérôme Raciazek
Technician
2018
2020
Valentin Marcon
Research Engineer
2018
2019
Laurent Bouri
Research Engineer (IFB-Core)
2021
2022
Hippolyte Kengni
Research Engineer (IFB-Core)
2021
2022
Lucie Lamothe
Research Engineer (IFB-Core)
2017
2022
Hervé Ménager
Research Engineer / Head
Projets
Logiciel
Outils
Financements
Publications
Télécharger-
2023Proteogenomic Characterization of Bladder Cancer Reveals Sensitivity to Apoptosis Induced by Tumor Necrosis Factor-related Apoptosis-inducing Ligand in FGFR3-mutated Tumors., Eur Urol 2023 Jun; (): .
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2023Epigenomic mapping identifies an enhancer repertoire that regulates cell identity in bladder cancer through distinct transcription factor networks., Oncogene 2023 Mar; (): .
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2022Methods Included, Communications of the ACM, 2022.
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2021ELIXIR and Toxicology: a community in development, F1000Research 2021, 10(ELIXIR):1129.
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2021Multitrait GWAS to connect disease variants and biological mechanisms., PLoS Genet 2021 Aug; 17(8): e1009713.
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2021Gene expression analysis in EBV-infected ataxia-telangiectasia cell lines by RNA-sequencing reveals protein synthesis defect and immune abnormalities., Orphanet J Rare Dis 2021 06; 16(1): 288.
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2021Viral Host Range database, an online tool for recording, analyzing and disseminating virus-host interactions., Bioinformatics 2021 Feb; (): .
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2021biotoolsSchema: a formalized schema for bioinformatics software description., Gigascience 2021 Jan; 10(1): .
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2021The iPPI-DB initiative: A Community-centered database of Protein-Protein Interaction modulators., Bioinformatics 2021 Jan; (): .
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2021Perspectives on automated composition of workflows in the life sciences., F1000Res 2021 ; 10(): 897.
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