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Présentation

La plateforme de protéomique, sous la responsabilité de Mariette Matondo, fait partie de l’unité de spectrométrie de masse structurale et protéomique Mass Spectrometry for Biology  Utechs (MSBio) dirigée par Julia Chamot-Rooke. . L’objectif de la plateforme est de mettre en place et de développer des stratégies d’analyses protéomiques bottom-up permettant l’identification, la caractérisation et la quantification à large échelle de protéines dans des échantillons complexes. Nos collaborateurs bénéficient de l’expertise technique des membres de la plateforme, et de l’accès à des spectromètres de masse de dernière génération, de type Orbitrap. Ces instruments offrent une grande précision de mesure, une très bonne sensibilité et une large gamme dynamique. Le traitement des données est réalisé au sein de la plateforme à l’aide d’outils bioinformatiques dédiés.

La plateforme propose différents types d’analyses protéomiques:

  • Identification de protéines faiblement abondantes dans des échantillons biologiques complexes
  • Protéomique quantitative
  • Caractérisation des modifications post-traductionnelles (PTMs)
  • Identification de complexes protéiques

Les analyses peuvent être réalisées dans le cadre d’une collaboration, ou traitées en tant qu’activité de service. La prise en charge d’un projet est définie lors d’une réunion préalable qui permet de déterminer la stratégie analytique globale (de la préparation des échantillons à l’analyse bioinformatique des données) qui sera mise en œuvre.

Pour soumettre votre projet à la plateforme, merci de compléter le formulaire et l’envoyer à proteomics@pasteur.fr

N’hésitez pas à nous contacter pour toute question, suggestion afin d’améliorer notre service : Réclamation / Suggestions

Projets

Services

Prices and Form

Prices are indicative and could be subject to change. This prices list  was updated in July 2014. For project proposals, please complete this form and send to proteomics@pasteur.fr    

Équipements

Orbitrap Velos Mass Spectrometer • Thermo Fisher • LTQ-Velos Orbitrap

The LTQ-Velos Orbitrap is equipped with a U3000 nanoLC (Dionex) and ETD. It is mainly used for the analysis of simple mixtures of proteins after trypsin digestion or PTM analysis using its ETD capabilities. 

Orbitrap Q-Exactive Mass Spectrometer • Thermo Fisher • Q-Exactive Plus & Q-Exactive HF

The Q-Exactive Plus and Q-Exactive HF are equipped with an easy-nLC (Proxeon) and have been installed in 2014/2015. They are used for: Protein identification (Data Dependent and Data Independent Analyses) Post translational modification (PTM) analysis […]

Financements

Publications

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Contact

Phone: Email: proteomics@pasteur.fr Proteomics Platform, Structural Mass Spectrometry and Proteomics Unit Institut Pasteur Centre François Jacob – 2nd floor 28 Rue du Docteur Roux 75015, Paris France