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Présentation

La plateforme de protéomique, sous la responsabilité de Mariette Matondo, fait partie de l’unité de spectrométrie de masse structurale et protéomique Mass Spectrometry for Biology  Utechs (MSBio) dirigée par Julia Chamot-Rooke. . L’objectif de la plateforme est de mettre en place et de développer des stratégies d’analyses protéomiques bottom-up permettant l’identification, la caractérisation et la quantification à large échelle de protéines dans des échantillons complexes. Nos collaborateurs bénéficient de l’expertise technique des membres de la plateforme, et de l’accès à des spectromètres de masse de dernière génération, de type Orbitrap. Ces instruments offrent une grande précision de mesure, une très bonne sensibilité et une large gamme dynamique. Le traitement des données est réalisé au sein de la plateforme à l’aide d’outils bioinformatiques dédiés. La plateforme propose différents types d’analyses protéomiques:

  • Identification de protéines faiblement abondantes dans des échantillons biologiques complexes
  • Protéomique quantitative
  • Caractérisation des modifications post-traductionnelles (PTMs)
  • Identification de complexes protéiques
  • Protéines entière par Top-down

Les analyses peuvent être réalisées dans le cadre d’une collaboration, ou traitées en tant qu’activité de service. La prise en charge d’un projet est définie lors d’une réunion préalable qui permet de déterminer la stratégie analytique globale (de la préparation des échantillons à l’analyse bioinformatique des données) qui sera mise en œuvre.

Les membres du Comité des Utilisateurs : Marco Bellinzoni, Serge Bonnefoy, Valérie Bouchez,Ludovic Deriano , Olivier Dussurget, Marie Flamand, Guilhem Janbon,Pierre Alexandr Kaminski, Pascale Pescher , Cosmin Saveanu,  Timothy Wai.

Les membres du Comité de Pilotage : Sandrine Sagan (CNRS), Joelle Vihn (ESPCI Paris ), Cosmin Saveanu (IP)

Comment travailler avec nous / Comment demander de l’aide

Pour soumettre votre projet à la plateforme, merci de compléter la demande sur PPMS .

Vous pouvez également contacter directement Mariette Matondo  pour une demande d’information via l’alias:  proteomics@pasteur.fr

N’hésitez pas à nous contacter pour toute question, suggestion afin d’améliorer notre service : Réclamation / Suggestions

Portes ouvertes

Les mardis à 10 h30. Merci de contacter Mariette Matondo à l’adresse suivante : proteomics@pasteur.fr

Enquête de satisfaction

Les liens des enquêtes de satisfaction sont présentées ci dessous par année :

La plateforme est certifiée ISO 9001.

La plateforme est labelisée IBiSA

Informations pratiques

Nous faisons partie du C2RT (Centre de Ressources Technologiques et de Recherche), un centre regroupant les unités de Technologie et de Service (UTechS) et les plateformes technologiques du campus. En tant que tel, nous suivons les directives communes et les bonnes pratiques de travail. Si vous n’avez pas trouvé ce que vous cherchiez, veuillez consulter la Brochure Technology Department C2RT-C2RA-C2Ri-CRBIP

Cliquer ici pour nous localiser

Services

Project request and Prices

For project proposals, please submit your project request here on PPMS (stratocore): for the facility use MSBio Core Facilty Request Form : https://ppms.eu/pasteur/req/?pf=29&project=true&form=68. Additionally, you can complete this form and send it to proteomics@pasteur.fr. […]

Équipements

Orbitrap Eclipse Tribrid Mass Spectrometer • Thermo Fisher • Orbitrap Eclipse™ Tribrid™ Mass Spectrometer

The Orbitrap Eclipse™ Tribrid™ mass spectrometer is cuppled witrh Neo Vanquish or an easy-nLC (Proxeon) and has been installed in January 2021. It is used for: – TMT quantification – Data Independent Acquisition (DIA) […]

Orbitrap Q-Exactive HF Mass Spectrometer • Thermo Fisher • Orbitrap Q Exactive™ HF

The Orbitrap Q-Exactive HF is equipped with an easy-nLC (Proxeon) and has been installed in 2014/2015. It is used for: Protein identification (Data Dependent and Data Independent Analyses) Post translational modification (PTM) analysis Quantitative […]

Orbitrap Fusion Lumos Mass Spectrometer • Thermo Fisher • Orbitrap Tribrid Fusion Lumos

An Orbitrap Fusion has been installed in 2013 and upgraded in Fusion Lumos in 2016. The instrument is equipped with ETD and used either with a nanoUPLC Dionex for online fragmentation or with a Nanomate for […]

Orbitrap Velos Pro Mass Spectrometer • Thermo Fisher • LTQ-Velos Orbitrap

The LTQ-Velos Orbitrap is equipped with a U3000 nanoLC (Dionex) and ETD. It is mainly used for the analysis of simple mixtures of proteins after trypsin digestion or PTM analysis using its ETD capabilities.

Orbitrap Q-Exactive Plus Mass Spectrometer • Thermo Fisher • Q-Exactive Plus

The Q-Exactive Plus is equipped with an easy-nLC (Proxeon) and has been installed in 2014/2015. It is used for: Protein identification (Data Dependent and Data Independent Analyses) Post translational modification (PTM) analysis Quantitative proteomics […]

Anciens Membres

2000
2000
Name
Position
2015
2020
Sahra Ouarti
Technician
2015
2020
Véronique Hourdel
Research Engineer
2015
2020
Nesrine El Omrani
Graduate Student
2015
2020
Maxime Bellami
Graduate Student
2020
2021
Elias Kotbachi
Master student
2013
2022
Thibault Chaze
Research Engineer
2022
2023
Rita Azevedo
Research Engineer

Projets

Projet Transversal

Financements

Partenaires

Publications

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Contact

Phone: Email: proteomics@pasteur.fr Proteomics Platform, Structural Mass Spectrometry and Proteomics Unit Institut Pasteur Centre François Jacob – 2nd floor 28 Rue du Docteur Roux 75015, Paris France