Le département Génomes et Génétique a été créé en 2006, reprenant une large partie des équipes qui formaient alors le département Structure et Dynamique des Génomes dirigé par Bernard Dujon. Le département rassemble 150 personnes au sein de 9 structures de recherche, dont le le Pôle “Biomics” et 19 équipes associées. Ces équipes explorent, par des approches expérimentales et informatiques, la nature de l’information génétique chez des organismes à complexité croissante, allant des bactéries à l’homme, en passant par les levures.
Les équipes du département Génomes et génétique travaillent principalement dans 4 domaines :
- La génomique évolutive
- Les 3 R (Recombinaison, Réplication et Réparation)
- Les réseaux fonctionnels et régulateurs
- Les interactions hôte – pathogène
Les équipes utilisent toute la palette des approches génomiques et post-génomiques pour l’étude des différents modèles, qu’ils soient bactériens (principalement, les bacilles de la tuberculose, streptocoques, vibrios, et légionelles) ou levures (Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe, et Candida albicans), comme en génétique humaine. Ces différents organismes, pathogènes ou modèles, font l’objet d’investigations poussées qui visent à comprendre leurs modes de vie et les déterminants de leur caractère pathogène. Les levures sont étudiées, à la fois pour leur intérêt propre et comme archétype pour mieux comprendre la génétique humaine. Le département se penche en outre sur l’évolution des agents infectieux et sur les pressions sélectives qu’ils ont exercées sur les gènes humains au cours du temps. L’avancée de ces différents programmes de recherche bénéficie fortement des progrès que connaissent actuellement les nouvelles technologies de séquençage et de génotypage, et dans lesquels nous sommes directement impliqués, en particulier grâce aux plateformes du département qui font partie de Biomics. Le département Génome et génétique développe aussi une très forte composante « in silico », en particulier autour de la modélisation des systèmes biologiques et l’analyse bioinformatique, développant ses propres projets de recherche, mais qui assure aussi un support aux différentes structures de recherche de l’Institut.
Retraite du département, Octobre 2023 (Pornichet, Loire-Atlantique)
