Le groupe Génomique Fonctionnelle Comparative s’intéresse aux mécanismes moléculaires qui permettent l’apparition de nouveautés évolutives chez les vertébrés par des changements dans leur séquence génétique, ou dans l’expression et la régulation de ces gènes. Notre modèle principal est l’évolution de la menstruation, un trait reproductif apparu relativement récemment dans l’histoire évolutive des primates, et que nous étudions en comparant des échantillons de tissus utérins de différents primates par une approche combinant analyses transcriptomiques et épigénomiques en cellules uniques, et analyses bioinformatiques. Nous développons également des méthodes computationnelles pour modéliser les changements dans l’expression et la régulation des gènes au cours du temps, et des modèles cellulaires en culture pour tester les conséquences moléculaires de changements évolutifs dans la fonction des gènes.
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Camille Berthelot
Responsable de Structure
Responsable
Projets
Financements
Principales publications
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2022Classification of non-coding variants with high pathogenic impact., PLoS Genet 2022 04; 18(4): e1010191.
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2021The bowfin genome illuminates the developmental evolution of ray-finned fishes., Nat Genet 2021 09; 53(9): 1373-1384.
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2021A community-led initiative for training in reproducible research., Elife 2021 06; 10(): .
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2021Creating clear and informative image-based figures for scientific publications., PLoS Biol 2021 03; 19(3): e3001161.
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2020Synteny-Guided Resolution of Gene Trees Clarifies the Functional Impact of Whole-Genome Duplications., Mol Biol Evol 2020 11; 37(11): 3324-3337.
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2019Adaptation of Proteins to the Cold in Antarctic Fish: A Role for Methionine?, Genome Biol Evol 2019 01; 11(1): 220-231.
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2018Complexity and conservation of regulatory landscapes underlie evolutionary resilience of mammalian gene expression., Nat Ecol Evol 2018 Jan; 2(1): 152-163.
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2015The 3D organization of chromatin explains evolutionary fragile genomic regions., Cell Rep 2015 Mar; 10(11): 1913-24.
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2015Enhancer evolution across 20 mammalian species., Cell 2015 Jan; 160(3): 554-66.
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