Le projet de l’Unité de Biologie des ARN des Pathogènes Fongiques se concentre sur l’étude de la structure et de la plasticité des transcriptomes des pathogènes fongiques humains. Nous utilisons principalement la levure basidiomycète Cryptococcus neoformans comme modèle, mais nous étudions également d’autres champignons pathogènes ou non pathogènes pour comparaisons. Nous utilisons diverses stratégies ‘OMICs’ pour étudier la diversité des isoformes d’ARNm et des long ARN noncodants de la cellule fongique. Nous nous intéressons également les mécanismes qui régulent cette diversité et leur impact sur la biologie des cellules fongiques. Ces résultats fondamentaux sont appliqués à des questions orientées vers l’étude de la virulence des champignons pathogènes, explorant comment la structure du transcriptome est régulée pendant l’infection et les conséquences de ces modifications tant pour le champignon que pour l’hôte.
Plus récemment, nous avons lancé des recherches sur les vésicules extracellulaires produites par les champignons. Notre projet explore bien sur la structure et la dynamique du transcriptome vésiculaire, mais aussi les voies de biosynthèse des vésicules extracellulaires. Nous étudions également les rôles de ces organelles extracellulaires dans la communication intercellulaire et les interactions hôte-pathogène. Cette deuxième partie du projet fait également partie de l’Unité internationale Pasteur “Vésicules Extracellulaires Fongiques”, dirigée en collaboration avec Robin May (Université de Birmingham, Royaume-Uni) et Marcio Rodrigues (Fiocruz, Brésil).
