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Présentation

Les activités scientifiques de l’Unité Génomique Evolutive des Microbes sont centrées sur l’analyse des génomes bactériens. Nous utilisons une approche inter-disciplinaire impliquant des outils de la bioinformatique et de la biostatistique sur des problèmes d’évolution moléculaire , de génétique des populations , et de génétique moléculaire . 

L’objectif de nos études est de mieux comprendre l’adaptation des bactéries, et en particulier celle de pathogènes émmergents. Nous nous concentrons sur quatre grandes questions:
1) Comment et pourquoi sont organisées génomes ?
2 ) Comment ces caractéristiques organisationnelles évoluent face à l’afflux d’information génétique d’autres génomes ?
3 ) Quels sont les rôles des éléments mobiles dans l’adaptation des bactéries ?
4 ) Comment est-ce que la dynamique du génome conditionne l’émergence de la virulence et/ou résistance aux thérapies à l’échelle microévolutive et épidémiologique ?

Membres

Anciens Membres

2000
2000
Name
Position
2015
2019
Todd Treangen
Post-doc, now Associated Professor Rice U (USA)
2015
2019
Sylvain Brisse
Researcher, now PI Institut Pasteur
2015
2019
Aude Bernheim
PhD Student, now PI Institut Pasteur
2015
2019
Julien Guglielmini
Post-doc, now Research Engineer at Institut Pasteur
2015
2019
Louis-Marie Bobay
PhD Student, now Assistant Professor NC State (USA)
2008
2009
Chris Smillie
Graduate Student, now PI Harvard Medical School (USA)
2015
2019
Sophie Abby
Post-doc, now tenured researcher CNRS
2015
2019
Jean Cury
PhD Student, now tenured researcher CNRS
2015
2019
Pedro Couto Oliveira
Post-doc, now PI CEA
2015
2019
Sara Vieira-Silva
PhD Student, now Professor U Mainz (Germany)
2015
2019
Mylène Maury
PhD student, now Computational Biologist, Boehringer Ingelheim
2015
2019
Camille Clerissi
Post-doc, now Assistant Professor, U Perpignan
2015
2019
Elise Larsonneur
Research Engineer
2015
2019
Joao P. Alves Gama
PhD Student (visiting), now post-doc
2015
2019
Marc Garcia-Garcera
Post-doc, now Microbiome specialist at Nestlé
2015
2019
Alexis Criscuolo
Research Engineer
2015
2019
Virginie Passet
Technician
2015
2019
Camille Blin
PhD Student, now teacher
2015
2019
Antoine Frenoy
Post-doc, now Assistant Professor U Grenoble
2015
2019
Elif Elçin
Graduate Student, now Postdoctoral Researcher at Max-Planck
2019
2020
Martin Guillemet
Graduate Student, now postdoc ETH Zurich
2017
2019
Fanny Wegner
Post-doc
2016
2019
Remi Denise
PhD Student, now post-doc U Cork
2018
2018
Tess Brewer
PhD Student (visiting), now post-doc U Zurich
2019
2019
Manuel Ares Arroyo
PhD Student (visiting), now post-doc Institut Pasteur
2019
2019
Stijn Wittouck
PhD Student (visiting), now post-doc University of Antwerp
2018
2018
Valerie de Crecy-Lagard
Prof in Sabbatical (University of Florida)
2019
2019
Chris M. Brown
Prof in Sabbatical (University of Otago)
2020
2020
Alonso Ruiz
PhD Student (visiting), now CTO Evolving Therapeutics
2018
2022
Matthieu Haudiquet
PhD Student, now post-doc Institut Curie
2021
2021
Neris Gonzalez
PhD Student (visiting), now post-doc
2022
2022
Laura Celestino
PhD Student (visiting)
2022
2023
Kristen Curry
PhD Student (visiting), now post-doc Institut Pasteur
2022
2022
Francesca D’Angelo
Post-doc
2022
2022
Janusz Koszucki
PhD Student (visiting)
2018
2023
Eugen Pfeifer
Post-doc, now Chair Young Professor INRAE
2016
2024
Olaya Rendueles
Postdoc, now senior CNRS researcher, Chair ANR Bio/Santé
2019
2024
Charles Coluzzi
Post-doc, now Chair Young Professor U Lyon
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