Milena Hasan

Nov 2025

Groupe: Développement des ILC et inflammation

Pasteur Course Advanced immunology

This intensive six-week course, including practical work, lectures, and scientific analysis workshops, covers the fundamental themes of cellular and molecular immunology. For more information and program, please, visit the course webpage.

Milieu Intérieur [LabEx]

Pierre-Emmanuel Joubert

Monica Sala

Hervé Waxin

Virginie Ponticelli

2025-11-17 09:00:00 2026-01-09 18:00:00 Europe/Paris Pasteur Course Advanced immunology This intensive six-week course, including practical work, lectures, and scientific analysis workshops, covers the fundamental themes of cellular and molecular immunology. For more information and program, please, visit the course webpage. Institut Pasteur, Rue du Docteur Roux, Paris, France

Jun 2025

Pasteur Course Single cell gene expression and beyond

The course offers comprehensive theoretical and practical training in all stages of high-throughput single-cell profiling, from sample and library preparation to data analysis. Participants will learn to apply cutting-edge technologies for single-cell multi-omics and […]

2025-06-25 09:00:00 2025-07-02 18:00:00 Europe/Paris Pasteur Course Single cell gene expression and beyond The course offers comprehensive theoretical and practical training in all stages of high-throughput single-cell profiling, from sample and library preparation to data analysis. Participants will learn to apply cutting-edge technologies for single-cell multi-omics and […] Institut Pasteur, Rue du Docteur Roux, Paris, France

Jun 2022

Single cell gene expression and beyond

Course Overview The course aims at providing theoretical and hands-on training for all steps of high-throughput single cell profiling, from single-cell sample and library preparation to data analysis, using state-of-the-art technological solutions. Program This […]

Single Cell Resources Initiative at Institut Pasteur

Immunologie

Centre de Ressources et Recherches Technologiques

Valentina Libri

Milena Hasan

2022-06-30 09:00:00 2022-07-06 18:00:00 Europe/Paris Single cell gene expression and beyond Course Overview The course aims at providing theoretical and hands-on training for all steps of high-throughput single cell profiling, from single-cell sample and library preparation to data analysis, using state-of-the-art technological solutions. Program This […] 28 Rue du Docteur Roux, Paris, France

Dec 2018

10th HKU-Pasteur Immunology Course: December 2-15, 2018

‘Quantitative Immunology’ will be the theme of the 10th anniversary of the HKU-Pasteur Immunology Course. We will explore the ongoing transition from reductionist studies, based on the application of genetic approaches in animal models, […]

Immunité innée

Pôle de Recherche Université de Hong Kong-Pasteur

Milieu Intérieur [LabEx]

2018-12-02 09:00:00 2018-12-15 18:00:00 Europe/Paris 10th HKU-Pasteur Immunology Course: December 2-15, 2018 ‘Quantitative Immunology’ will be the theme of the 10th anniversary of the HKU-Pasteur Immunology Course. We will explore the ongoing transition from reductionist studies, based on the application of genetic approaches in animal models, […] HKU-Pasteur Research Centre, Hong Kong

Projets Transversaux

Single Cell Resources Initiative at Institut Pasteur

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The Healthy Human Global Project

Le projet Milieu Intérieur est l’un des lauréats de la première vague d’appel d’offre “Laboratoire d’Excellence” lancé dans le cadre du programme de relance économique « Investissements d’avenir » du gouvernement français. Le projet […]

Projets

5 Membres

Mise au point d’une méthode de dosage de molécules inflammatoires par prélèvement capillaire dans la coqueluche : PERTSEVERE II-SIMOA SETUP (2025-014)

Sylvain Brisse (PI)

PERTSEVERE II- SIMOA SETUP est une demande d’utilisation à des fins scientifiques de données et d’échantillons de participants de la cohorte COSIPOP. Quel est l’objectif ? L’objectif de la demande de développer une technique […]

Apprentissage de l’utilisation de technologies de pointe d’analyse de marqueurs de la réponse immunitaire dans le cadre du Master 2 intitulé « Immunologie approfondie » TPAI (2023-027)

TPAI est une demande d’utilisation de données et d’échantillons biologiques collectés dans le cadre de la cohorte COSIPOP. Quel est l’objectif de TPAI ? L’objectif est de permettre à des étudiants d’apprendre à utiliser […]

En attente

3 Membres

Développement et validation de technologies de pointe d’analyse de la réponse immunologique : TTP (2024-005)

TTP est une demande d’utilisation d’échantillons collectés dans le cadre du projet de recherche COSIPOP. Quel est l’objectif ? L’objectif de la demande est le développement et la validation de technologies de pointe d’analyse […]

En attente

5 Membres

Développement d’une technique d’analyse de la réponse immunitaire permettant d’évaluer l’efficacité de vaccins anti-cancer : IMMUNSCAN-PILOTE (2023-005)

IMMUNSCAN-PILOTE est une recherche scientifique menée grâce à l’utilisation de données et d’échantillons biologiques collectées dans le cadre de la cohorte COSIPOP. Quel est l’objectif d’IMMUNSCAN-PILOTE ? L’objectif est de mettre au point, à […]

Étude du rôle des oxylipines dans la survenue des formes sévères des COVID-19 : VARIANCE (2023-016)

VARIANCE est une recherche scientifique menée grâce à l’utilisation de données et d’échantillons biologiques collectés auprès de participants de la cohorte COSIPOP. Quel est l’objectif scientifique ? L’objectif est est de mettre au point […]

En attente

6 Membres

PERT-SEVERE II – Impact de l’expression bactérienne et de la réponse immunitaire dans la gravité de la coqueluche

Julie Toubiana (PI)

Contexte et objectifs de l’étude PERT-SEVERE II La coqueluche est une infection bactérienne respiratoire, très contagieuse et d’évolution longue. Elle peut être grave chez le petit nourrisson, mais nous ne comprenons pas bien les […]

5 Membres

Understanding protective humoral immunity in asymptomatic dengue-infected individuals

Tineke Cantaert (PI)

Dengue is caused by dengue virus (DENV), a virus which can be transmitted by Aedes mosquitos. Half of the world’s population live in areas where the mosquito and the virus are circulating. Infection by […]

3 Membres

Single cell projects

Numerous research groups from the Institut Pasteur, from the Pasteur International Network (RIIP) and from various external academic and clinical institutions benefit from the single cell resources of the Institut Pasteur. The groups with […]

Terminé

16 Membres

CoSImmGEn-F : constitution d’une cohorte de sujets atteints de polypose adénomateuse familiale et porteurs d’une mutation du gène APC afin d’étudier le rôle de la génétique du système immunitaire et de l’environnement dans la maladie

Hélène Laude (PI)

Rationnel La polypose adénomateuse familiale se manifeste par l’apparition dans l’intestin de nombreuses excroissances dénommées polypes adénomateux et susceptibles d‘évoluer en cancers en l’absence de prise en charge. Il s’agit d’une maladie génétique, le […]

6 Membres

Deciphering dormancy in Cryptocococcus neoformans

Alexandre Alanio (PI)

Cryptococcus neoformans is a sugar-coated yeast that is able to interact closely with numerous organisms in the environment including amebae, paramecium of nematodes. The interaction with these organisms probably shaped its virulence. The ability […]

21 Membres

Protected: Pasteur Human Genome

Thomas Bourgeron (PI)

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Logiciel

Ingenuity (Qiagen)

intuitive web-based applications for quickly analyzing and accurately interpreting the biological meaning in real-time PCR, sequencing or microarray data.

Logiciel

IDEAS (Amnis)

software developed for the analysis of ImageStreamX data; it evaluates over 35 features for each image and over 200 features per cell and integrates population statistics and imagery – every dot on a scatter […]

Logiciel

Qlucore Omics Explorer

A statistical software package optimized for gene expression studies and principal component analysis

Outils

Outil

3 Membres

Single Cell Proteomics

Successful extension of mass spectrometry-based (MS) proteomics to single cells is very challenging, mainly due to low analysis throughput and insufficient proteome coverage in single cells. To address these challenges, new pipelines have emerged […]

Outil

4 Membres

Single Cell Data Analysis