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09:00
10
May 2016
Cours

Morning session – Introduction to NGS data analysis

The Hub of Bioinformatics and Biostatistics at the Institut Pasteur organizes thematic courses open to everybody. The second session, entitled “Introduction to NGS data analysis” will take place every Tuesday, from the May 10th […]
Centre de Bioinformatique, Biostatistique et Biologie Intégrative
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Vittore Scolari
2016-05-10 09:00:00 2016-06-28 12:00:00 Europe/Paris Morning session – Introduction to NGS data analysis The Hub of Bioinformatics and Biostatistics at the Institut Pasteur organizes thematic courses open to everybody. The second session, entitled “Introduction to NGS data analysis” will take place every Tuesday, from the May 10th […] 28 Rue du Dr Roux, Paris, France

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Bioconvert

Thomas Cokelaer (PI)

Bioconvert is a collaborative project to facilitate the interconversion of life science data from one format to another. Life science uses many different formats. They may be old, or with complex syntax and converting […]
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Dynamics of high avidity CD4+ T cell clonotypes directed at HIV-1 capsid

Lisa Chakrabarti (PI)

We obtained recent evidence that CD4+ T cells of HIV Controllers preferentially express a particular set of shared T cell receptors (TCRs) directed to the HIV capsid. We will  monitor the dynamics of these […]
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Completed
9 Membres

ANR TransLeish – Discovery of druggable protein kinases in the protozoan parasite Leishmania donovani using hit compounds identified by phenotypic screening

Najma Rachidi (PI)

The protozoan parasite Leishmania donovani causes fatal visceral leishmaniasis, one of the most neglected tropical diseases. In the absence of economic incentive, serious Research and Development (R&D) investments into anti-leishmanial drug development lack from […]

Logiciel

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En cours
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JASS – Joint Analysis of (GWAS) Summary Statistics

Hugues Aschard (PI)

JASS is a python package that handles the computation of the joint statistics over sets of selected GWAS results, and the interactive exploration of the results through a web interface. The generation of joint […]
software
En cours
4 Membres

Listeriomics: an Interactive Web Platform for Systems Biology of Listeria

Christophe Becavin (PI)

Listeriomics integrates all complete genomes, transcriptomes and proteomes published for Listeria species to date. It allows navigating among all these datasets with enriched metadata in a user-friendly format. listeriomics.pasteur.fr The main purpose of the website is […]
software
Completed
2 Membres

SynTView

Pierre Lechat (PI)

SynTView is a comparative and interactive viewer for microbial genomes, designed to run as either a web-based tool (Flash technology) or a desktop application (AIR environment). The basis of the program is a generic […]
software
En cours
8 Membres

SHAMAN: SHiny Application for Metagenomic ANalysis

Amine Ghozlane (PI)

SHAMAN is a SHiny Application for Metagenomic ANalysis including the normalization, the differential analysis and mutiple visualization. SHAMAN is based on DESeq2 R package [Anders and Huber 2010] for the analysis of metagenomic data, […]

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