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Starting Date
19
Jan 2009
Ending Date
31
Dec 2020
Status
Ongoing
Members
12
Structures
2
Publications
8

About

Type of collection :

Open cohort with a direct implementation for scientific purposes.
The collection constituted of samples collected from a prospective cohort of healthy volunteers.

Rationale :

The development of biological and molecular analysis techniques allowed characterization of micro-organisms responsible for long-time known diseases, but also for emergent agents such as the SRAS virus or more recently, the Zika virus. However, the diagnosis of an infection is still often based on isolation and even culture of the infectious agent from a biological sample, within long processes of several days (or even several weeks for the culture of agents like for tuberculosis). It is therefore necessary to develop tests that respect the principles of development of the diagnostic methods in an epidemic context: speed, reliability, simplicity and low cost.

Currently, new diagnostic methods based on various techniques are being developed at the Institut Pasteur in the different fields of infectious and tropical pathology :

  • Direct method allowing the detection of pathogens within samples;
  • Microbial genome detection with a specific nucleotidic chip (DNA or RNA);
  • Detection of viral, bacterial or parasitic products (for example a specific protein) by an antibody or an “artificial” receptor;
  • Indirect method allowing the detection of the infection by identifying in the blood or any other biological sample (such as saliva and cerebrospinal fluid) the host  immune reactions and particularly the production of specific antibodies against the infectious agent (like ELISA or Luminex tests).

 Recruitment method :

Healthy subjects are recruited at the ICAReB platform (Center for Translatinal Science) with:

  • Volunteers already included in others ICAReB platform’s cohort;
  • New volunteers informed through posters or web advertisement or during targeted communication campaign.

Bioresources :

  • The following samples and their by-products are available : whole blood (serum, plasma, peripheral blood mononuclear cells, red blood cells), urines, feces, saliva, buccal or cutaneous swabs and tears;
  • Bioclinical data including in particular personal and familial medical history and lifestyle informations.

Type de collection :

Cohorte ouverte. Mise en place de la collection directement à des fins scientifiques, à partir d’échantillons prélevés sur une cohorte prospective de volontaires sains.

Introduction :

Le développement des techniques d’analyse biologique et moléculaire a permis de caractériser les micro-organismes responsables de maladies connues depuis longtemps, mais aussi d’agents émergents tels que l’agent du SRAS ou plus récemment, le virus Zika. Cependant, le diagnostic d’une infection repose encore souvent sur l’isolement voire la culture en laboratoire de l’agent infectieux à partir d’un prélèvement, ce qui entraîne des délais minimaux de plusieurs jours (voire plusieurs semaines pour la culture d’agents comme celui de la tuberculose). Il est donc nécessaire de développer des tests qui répondent aux principes de développement des méthodes diagnostiques dans un contexte épidémique : rapidité, fiabilité, simplicité et faible coût.

Actuellement, des nouvelles méthodes diagnostiques basées sur des techniques variées sont en développement à l’Institut Pasteur dans les différents domaines de la pathologie infectieuse et tropicale en virologie, bactériologie et parasitologie :

  • Détection directe du pathogène dans le prélèvement
  • Détection du génome du micro-organisme grâce à une sonde nucléotidique spécifique (puces à ADN ou ARN);
  • Détection de produits viraux, bactériens ou parasitaires (par exemple une protéine caractéristique d’un pathogène) par un anticorps ou un récepteur « artificiel ».

Méthode indirecte permettant de déceler dans le sang ou dans tout autre produit biologique (tels que la salive ou le liquide céphalo-rachidien) les réactions immunitaires de l’hôte et en particulier la production d’anticorps spécifiques contre l’agent infectieux  (tels que les tests ELISA ou Luminex)

Méthode de recrutement :

Les sujets sains sont recrutés à la plate-forme ICAReB à partir (Centre de Recherche Translationnelle) :

  • de volontaires déjà inclus dans d’autres cohortes de la plate-forme ICAReB;
  • et d’un recrutement de nouveaux volontaires par voie d’affichage, via le site internet de la plate-forme ou lors de campagnes de communication ciblées.

Bio ressources :

  • Échantillons & leurs sous-produits suivants : sang total (sérum, plasma, cellules mononuclées du sang, globules rouges), urines, fèces, salive, écouvillons buccaux, biopsies cutanées et larmes;
  • Données biocliniques incluant notamment les antécédents médicaux familiaux et personnels et des informations sur le mode de vie.

Fundings

References