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Cours
Introduction à l’analyse Bio-informatique de séquences
L’objectif de cette formation est de présenter, au travers de l’utilisation d’outils largement utilisés, quelques grands principes sur l’analyse de séquence. L’ensemble de la formation combine exposés théoriques (fondements méthodologiques des programmes) et applications […]
2019-09-23 09:00:00
2019-09-27 17:00:00
Europe/Paris
Introduction à l’analyse Bio-informatique de séquences
L’objectif de cette formation est de présenter, au travers de l’utilisation d’outils largement utilisés, quelques grands principes sur l’analyse de séquence. L’ensemble de la formation combine exposés théoriques (fondements méthodologiques des programmes) et applications […]
Institut Pasteur, Rue du Docteur Roux, Paris, France
Analyse de séquences
OBJECTIFS : Les biologistes sont régulièrement confrontés à des gènes (ou des protéines) de fonctions inconnues ou mal annotés. Dans ce contexte, maîtriser quelques techniques basiques d’analyse de séquences peut se révéler d’une aide […]
2018-03-19 09:30:00
2018-09-23 17:00:00
Europe/Paris
Analyse de séquences
OBJECTIFS : Les biologistes sont régulièrement confrontés à des gènes (ou des protéines) de fonctions inconnues ou mal annotés. Dans ce contexte, maîtriser quelques techniques basiques d’analyse de séquences peut se révéler d’une aide […]
Institut Pasteur, Rue du Docteur Roux, Paris, France
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Publications
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2024Alternative TSS use is widespread in Cryptococcus fungi in response to environmental cues and regulated genome-wide by the transcription factor Tur1., PLoS Biol 2024 Jul; 22(7): e3002724.
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2024Metabolic reprogramming during Candida albicans planktonic-biofilm transition is modulated by the transcription factors Zcf15 and Zcf26., PLoS Biol 2024 Jun; 22(6): e3002693.
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2024A gain-of-function mutation in zinc cluster transcription factor Rob1 Drives Candida albicans adaptive growth in the cystic fibrosis lung environment., PLoS Pathog 2024 Apr; 20(4): e1012154.
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2023Coregulation of extracellular vesicle production and fluconazole susceptibility in Cryptococcus neoformans, mBio, 2023, pp.e00870-23. ⟨10.1128/mbio.00870-23⟩.
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2022A phylogenetically-restricted essential cell cycle progression factor in the human pathogen Candida albicans., Nat Commun 2022 Jul; 13(1): 4256.
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2021Candida albicans Isolates 529L and CHN1 Exhibit Stable Colonization of the Murine Gastrointestinal Tract., mBio 2021 Dec; 12(6): e0287821.
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2021Factors that influence bidirectional long-tract homozygosis due to double-strand break repair in Candida albicans., Genetics 2021 Mar; (): .
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2020Use of CRISPR-Cas9 To Target Homologous Recombination Limits Transformation-Induced Genomic Changes in Candida albicans., mSphere 2020 09; 5(5): .
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2020Epidemiological investigation for grouped cases of Trichosporon asahii using whole genome and IGS1 sequencing., Mycoses 2020 Sep; 63(9): 942-951.
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2020Large-scale genome mining allows identification of neutral polymorphisms and novel resistance mutations in genes involved in Candida albicans resistance to azoles and echinocandins., J Antimicrob Chemother 2020 04; 75(4): 835-848.
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