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09:00
10
May 2016
Cours

Morning session – Introduction to NGS data analysis

The Hub of Bioinformatics and Biostatistics at the Institut Pasteur organizes thematic courses open to everybody. The second session, entitled “Introduction to NGS data analysis” will take place every Tuesday, from the May 10th […]
Claudia Chica
Frédéric LEMOINE
Jack Christophe Cossec
Hugo Varet
Anne Biton
Natalia Pietrosemoli
Guilhem Janbon
Rachel Torchet
Pierre Lechat
Amine Ghozlane
Nicolas Maillet
Axel Cournac
2016-05-10 09:00:00 2016-06-28 12:00:00 Europe/Paris Morning session – Introduction to NGS data analysis The Hub of Bioinformatics and Biostatistics at the Institut Pasteur organizes thematic courses open to everybody. The second session, entitled “Introduction to NGS data analysis” will take place every Tuesday, from the May 10th […] 28 Rue du Dr Roux, Paris, France Add to Calendar

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Chromosight: A computer vision program for pattern detection in chromosome contact maps

Romain Koszul (PI)

Chromosomes of all species studied so far display a variety of higher-order organizational features such as domains, loops, or compartments. Many of these structures have been characterized from the genome-wide contact maps generated by […]
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Terminé
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GRAAL: genome assembly from chromosome contact frequencies

Christophe Zimmer (PI)

A software to reconstruct 1D genome structures from 3D contact data obtained from Hi-C experiments. This movie shows the iterative assembly by GRAAL of the Trichoderma reesei genome (right) using contact frequencies determined by […]
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META3C (MetaHiC), metaTOR

Romain Koszul (PI)

https://github.com/koszullab/metaTOR We have pushed further our analysis about the potential of 3D contact data to solve genomics limitations and problems. We have developed meta3C, a metagenomic chromosome conformation capture approach that allows characterizing individual […]

CV

  • HDR Université Paris Saclay – June 2022
  • Ph.D Interface Physics-Biology, Université Paris Cité – December 2009
  • M.Sc. in Theoretical Physics, Université Paris Saclay – June 2006, speciality in Physics of Biological Systems

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