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Scientific Fields
Diseases
Organisms
Applications
Technique
Starting Date
23
Sep 2019
Ending Date
27
Sep 2019
Time
09:00:00
Institut Pasteur, Rue du Docteur Roux, Paris, France
Address
2019-09-23 09:00:00 2019-09-27 17:00:00 Europe/Paris Introduction à l’analyse Bio-informatique de séquences L’objectif de cette formation est de présenter, au travers de l’utilisation d’outils largement utilisés, quelques grands principes sur l’analyse de séquence. L’ensemble de la formation combine exposés théoriques (fondements méthodologiques des programmes) et applications […] Institut Pasteur, Rue du Docteur Roux, Paris, France Corinne Maufrais corinne.maufrais@pasteur.fr

L’objectif de cette formation est de présenter, au travers de l’utilisation d’outils largement utilisés, quelques grands principes sur l’analyse de séquence. L’ensemble de la formation combine exposés théoriques (fondements méthodologiques des programmes) et applications pratiques (mise en relation des notions théoriques avec les paramètres des programmes et les résultats obtenus) pour permettre une utilisation autonome et critique de quelques logiciels d’analyse des séquences biologiques.

Programme:

Jour 1 : Corinne Maufrais
• Matin : Introduction générale et Organisation des banques de données publiques
• Après-midi : Recherche d’information dans les banques de données publiques

Jour 2 : Varun Khanna / Corinne Maufrais
• Matin: Comparaison et alignement de deux séquences. Varun Khanna
• Après-midi : Recherche de séquences similaires dans les banques de données

Jour 3 : Corinne Maufrais
• Matin : Comparaison et alignement multiple de séquences
• Après-midi : Recherche et extraction de motifs (pattern/profils/HMM/logo).

Jour 4 : Damien Mornico
• Introduction à l’annotation de génome

Jour 5 : Frédéric Lemoine
• Introduction à la phylogénie (Cours + TP)

 

Location

Location: Institut Pasteur, Rue du Docteur Roux, Paris, France