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European Reference Laboratory for Public Health on Diphtheria and Whooping cough

Sylvain Brisse (PI)

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PER-SEVERE : Définir la contribution des facteurs microbiens et de l’immunité de l’hôte à la gravité de la coqueluche

Carla Rodrigues (PI)

La coqueluche est une maladie respiratoire causée par une bactérie (Bordetella Pertussis) qui peut, dans certains cas et notamment chez les nourrissons, être sévère voire mortelle (on parle alors de coqueluche maligne). L’objectif de […]
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Oxford Nanopore sequencing for detection and surveillance of pathogens

Chiara Crestani (PI)

This project intends to share expertise, developments, equipement and bioinformatics tools to apply Oxford Nanopore Technology sequencing to the detection, diagnostic and characterization of pathogens of public health importance. It corresponds to a collaboration […]
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KlebNet: a One Health network bridging science and surveillance on antimicrobial resistant Klebsiella

Sylvain Brisse (PI)

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Population biology of the bacterial pathogen Klebsiella pneumoniae

Sylvain Brisse (PI)

Klebsiella pneumoniae is one of the most urgent threats to public health given its increasing resistance to antimicrobial agents including carbapenems, considered as last-resort antibiotics.  In this project we aim to understand the ecological, epidemiological and […]
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17 Membres

Genomic taxonomy of bacterial strains: universal nomenclatures for epidemiology and population biology

Sylvain Brisse (PI)

High-throughput sequencing has revolutionized our abilities to track and characterize novel bacterial strains as they emerge and disseminate globally. Genome-based epidemiological typing systems provide ultimate resolution for strain discrimination. Genome sequences may also be […]

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