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© Inria / Photo C. Morel
Quantitative biology: numbers and fluorescent cells. InBio team (Inria/Institut Pasteur)
Laboratoire

InBio: Méthodes expérimentales et computationnelles pour la modélisation des processus cellulaires

Département de Biologie Computationnelle

Grégory Batt

Head
Département de Biologie Computationnelle
Département de Génomes et Génétique [Affiliation secondaire]

Présentation

Cliquer ici pour voir la page (en anglais).

Membres

Grégory Batt
Responsable de Structure
Responsable
Sara Napolitano
Ingénieur(e) de Recherche
François Bertaux
Visiteur(euse) Scientifique
Lorenzo Pasotti
Visiteur(euse) Scientifique
Angelica Frusteri Chiacchiera
Post-doctorant(e)
Esteban Lebrun
Post-doctorant(e)
Eléonore Pourcelot
Post-doctorant(e)
Henri Galez
Etudiant(e) en thèse
Viktoriia Gross
Etudiant(e) en thèse
Alicia Da Silva
Etudiant(e) en thèse
Cecilia Pires de Oliveira Capela
Etudiant(e) en thèse
Inès Dahlal
Etudiant(e) en alternance

Anciens Membres

We are grateful to former InBio members:

  • Eléa Greugny (Intern, INSA Lyon, Summer 2017; now PhD student in Computational Biology at Johnson & Johnson and Inria Saclay),
  • Laura Guyot (R & D Technology Engineer at Dassault Systems, May 2017 – Aug 2017 part time; permanent position),
  • Matthieu Pichené (Postdoc, ANR, Inria, Apr 2018 – Jul 2018),
  • Shuang Li (Intern, CRI, Spring 2018),
  • Elise Weill (PhD candidate, Paris-Saclay Univ, Sep 2018 – Aug 2019; now high school teacher),
  • Maxim Kryukov (Intern, Amgen program, MIPT, Summer 2018; now 4th year at MIPT),
  • Martin Larralde (Intern, ENS Saclay, Summer 2018; now PhD candidate at EMBL Heidelberg),
  • Albin Salazar (Intern, CRI, Spring 2019; now PhD candidate at ENS Paris),
  • Mariela Furstenheim (Intern, CRI, Spring 2019; now PhD candidate at Institut Curie),
  • Andjela Davidovic (Engineer, Hub Pasteur, Jun 2018 – Apr 2020 part time; permanent position)
  • Thomas Wahl (Intern, Medical Doctor student, Master 1, Summer 2020)
  • Sacha Maire (Intern, Biomedical engineering, Imperial College, Summer 2020)
  • Steven Fletcher (Engineer, Feb 2017 – Aug 2020)
  • Zach Fox (Postdoc, Jul 2019 – Oct 2020, now Postdoctoral Researcher, Los Alamos National Lab, link)
  • Virgile Andreani (PhD student and postdoc, Sept 2016 – June 2021, now Postdoctoral researcher, Boston University, link)
  • Chetan Aditya (PhD student, Feb 2018 – Sept 2021)
  • Olivier Borkowski (Postdoc, Oct 2019 – Oct 2021, now Research scientist, INRA, link)

Financements

Principales publications

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Lab Equipment

Our lab is equipped with state-of-the-art instruments that enable us to construct experimental platforms to investigate cellular processes at the population and single cell level:

  • a diverse range of small-volume bioreactors: a 16-reactor eVOLVER system, 8 Chi.Bio reactors, and a home-made 16-reactor array,
  • two opentrons OT-2 liquid handler robots, equipped with temperature and magnetic modules,
  • two table-top Guava easyCyte flow cytometers (HT BGV) with auto-sampler for 96-well plates,
  • two Tecan Spark multimode plate readers,
  • a Leica DMi8 fully-automated microscope with an Andor Mosaic 3 DMD system and two CoolLED pE-4000 light sources, together with a cellAsic Onix2 system and a set of Fluigent Flow EZ flow controllers for microfluidics,
  • lab equipment for molecular biology and microbiology (biosafety level 2),
  • two 96-core compute nodes and access to the Maestro cluster (15k cores, 70 GPU, 1PB rapid storage).


 

Images & Médias

Analyzing the resistance of pathogenic bacteria to antibiotic treatments. Experimentation nurture modeling and optimization guides lab work. Sebastian Sosa Carrillo and Virgile Andréani, PhD students in the InBio team (Inria/Institut Pasteur). Credit: C. Morel
Microscopy platform: epifluorescence microscope with microfluidic system, image analysis and software to control the experiment. Steven Fletcher, engineer in the InBio team (Inria/Institut Pasteur). Credit: C. Morel
Quantitative biology: numbers and fluorescent cells. InBio team (Inria/Institut Pasteur). Credit: C. Morel
Engineering biological systems: reaction diagrams and differential equations. Elise Weill-Duflos, PhD student, Shuang Li, master student, and Virgile Andréani, PhD student, in the InBio team (Inria/Institut Pasteur). Credit: C. Morel
Scientific interactions between members of the InBio team (Inria/Institut Pasteur). Credit: C. Morel
Members of the InBio team (Inria/Institut Pasteur). From left to right: Shuang Li (master student), François Bertaux (engineer), Virgile Andréani (PhD student), Arthur Carcano (PhD student), Steven Fletcher (engineer), Chetan Aditya (PhD student), Elise Weill-Duflos (PhD Student), Gregory Batt (research scientist), Matthieu Pichené (postdoctoral researcher), and Sebastian Sosa Carrillo (PhD student). Missing that day: Andjela Davidovic (engineer) and Jakob Ruess (research scientist). Credit: C. Morel

Contact

Address
4th floor @ Yersin building (main room: 24-04-05) & 2nd floor @ Lwoff building (main room: 22-02-17) 28 rue du Docteur Roux 75015 Paris
Email & Tel
Gregory.Batt_at_inria.fr +33 1 40 61 39 99
Assistant (Inria)
Christine Anocq christine.anocq_at_inria.fr +33 1 80 49 40 41
Assistant (Pasteur)
Denise Derhy denise.derhy_at_pasteur.fr +33 1 45 68 82 48