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© Ahmed Haouz
Cristaux d'une protéine de Mycobacterium tuberculosis produits dans le cadre du Grand Programme Horizontal sur la Tuberculose à l'Institut Pasteur. La caractérisation structurale de protéines mycobactériennes aide à une meilleure compréhension de la physiologie et de la pathogénicité des mycobactéries et fournit un point de départ pour la conception de nouveaux agents antibactériens.

Présentation

Le premier objectif de la plate-forme est de fournir aux équipes de recherche travaillant dans le domaine de la cristallographie macromoléculaire à l’Institut Pasteur, l’expertise et la technologie requises pour la cristalogénèse automatisée, les mesures de diffraction des rayons X et le calcul cristallographique en tant que plateforme de référence. La plateforme a obtenu un financement important de l’Institut Pasteur ainsi que de sources externes telles que le National Genopole Network (RNG-France), et de GIS-IBISA nous permettant de moderniser ou d’acquérir de nouveaux équipements. Notre pipeline de cristallogénèse est aujourd’hui le plus automatisé parmi les établissements académiques en France. Chaque année, plus de 900 échantillons de protéines différents sont soumis à des essais de cristallisation automatisés. La plupart de ces échantillons (environ 80%) proviennent de groupes de recherche cristallographique au sein du département Biologie Structurale & Chimie et du département Virologie de l’Institut Pasteur. Les 20 % restants proviennent d’entités hors campus (Institut de biologie physico-chimique, CEA-Saclay, Universités Paris 7, Paris 6, etc…).

Notre deuxième mission est d’offrir une expertise en bio-cristallographie, de la cristallilogénèse à la résolution de structures cristallines 3D. Nous assurons cette mission en participant en tant que partenaire à des projets de recherche scientifique (ANR, PTR, et collaborations individuelles) impliquant des études structurelles de protéines uniques et de complexes protéiques. Ces projets découlent d’une collaboration directe avec des groupes de recherche de l’Institut Pasteur et des organismes de recherche extérieurs.

Système automatisé pour le service de cristallisation :

–   Le poste de travail Tecan Gemini 150 pour la manipulation des liquides.
–   Le robot MOSQUITO peut être utilisé pour les gouttes sitting drops ou hanging drops (de 100 à 1000nl).
–   Le robot MATRIXMAKER peut concevoir automatiquement les écrans de cristallisation souhaités sur différents supports (tube de 50 ml, tube de 15 ml, bloc de 96 puits profonds ou plaque VDX de 24 puits).

Service de diffraction des rayons X :

–   Un générateur de rayons X RIGAKU micromax 007 avec anode rotative standard (longueur d’onde 1,54 Å, cuivre).
–   Un système d’optique à rayons X multicouches OSMIC.
–   Un détecteur de rayons X de plaque d’image MAR345DTB de MARESEARCH.
–   Un système cryogénique d’OXFORD INSTRUMENTS pour collecter des données de diffraction à température d’azote liquide.

Avec ce système, les utilisateurs peuvent répondre à plusieurs questions :

–   Mes cristaux sont-ils des protéines ou des sels?
–   Qu’est-ce que la cellule unitaire ou le groupe spatial de mon cristal?
–   Quelle est la meilleure cryo-solution pour congeler mon cristal ?

Il est également possible de collecter des données complètes pour les cristaux de protéines indigènes.
=> Pour plus d’information voir la section “services“.

Pour en savoir plus sur la Direction de la Technologie, voir ici.

Services

X-ray diffraction

  X-Ray Diffraction system is composed by : –    A RIGAKU micromax 007 X-ray generator with standard rotating anode (wavelength 1.54 Å). –    A system of multi-layer X-ray optics from OSMIC. –    A mar345dtb […]

Crystal optimization

Crystal optimization service To refine the conditions of crystallization, the robot Matrixmaker allows to generate solutions of crystallization on various kind of supports (tubes 50 ml, tubes 15 ml, tube Eppendorf 1.5 or 2 […]

High-Throughput Crystallization Screening

Application process of crystallization at 18°C or 4°C In the platform we can setup high-throughput crystallization experiments (18°C or 4°C) with the vapour diffusion (sitting or hanging drop), the microbatch, and the cubic phase […]

Équipements

AKTA Purifier • •

  AKTA Purifier: for the purification of proteins

Serveur Bi-Processeur Intel Xeon • •

  Serveur Bi-Processeur Intel Xeon: disk bay RAID Fibrenetix For data analysis and storages

X-ray diffraction system • •

  includes: – X Ray generator (Rigaku MicroMax-O7) – Rotating anode with copper. – MarResearch 345dtb image plate detector – Oxford 600 cryo-cooling system

Robot Matrixmaker • •

  Robot Matrixmaker: to design  crystallization solutions Possible supports: Deep-Well 96, VDX(24 well), tubes: 1ml, 2ml , 15ml, 50ml.

Robot Formulatrix • •

  Robot Formulatrix: Imaging of drops and crystals Imaging scheduling  

Robot Mosquito • •

  Robot Mosquito: Nanodrop crystallization Drop volumes from 100 to 1000nl Sitting drop/ Hanging drop possible

Robot Cartesian • . • .

  Robot Cartesian technologies: Cartesian technologies Nanodrop cristallization. One drop volume : 200nl Sitting drop only

Robot Genesis workstation • Tecan •

Robot Genesis workstation: 150 Tecan Pipetting station

Anciens Membres

2000
2000
Name
Position
2015
2019
Sakina Kandouz
Undergraduate Student
2015
2019
Isabelle Miras
Technician
2011
2016
Jocelyne Fraysse
Administrative Staff - retired
2015
2019
Frederick Saul
Retired scientist
2016
2021
Christine Detchepare
Administrative Staff - retired
2022
2023
Mohamed-Mourad Kenfaoui
Undergraduate Student
2023
2023
Anouar El Jid
Undergraduate Student

Projets

Financements

Communications and courses

Images & Médias

Contact

Phone : 01 40613930 Email : pf6@pasteur.fr Adress : 25 Rue du Docteur Roux 75724, Paris France