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Publié sur PloS one - 20 Dec 2010

Berthet N, Deletoile A, Passet V, Kennedy GC, Manuguerra JC, Cole ST, Brisse S

Lien vers Pubmed [PMID] – 21187950

PLoS ONE 2010;5(12):e15243

We describe the benefit of using reconstructed ancestral sequences (RAS) on resequencing microarrays for rapid pathogen identification, with Enterobacteriaceae rpoB sequences as a model. Our results demonstrate a sharp improvement of call rate and accuracy when using RASs as compared to extant sequences. This improvement was attributed to the lower sequence divergence of RASs, which also expanded the sequence space covered by the microarray. Extension of this novel microarray design strategy to viruses, antimicrobial resistance elements or toxins is straightforward.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21187950