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Projets
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CV
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2015PhD in computer science LRI, Paris-Saclay University
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2012Master degree Paris-Saclay University
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2009Engineer degree Polytec Paris Sud, Paris-Saclay University
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2006DUT IUT Orsay, Paris-Saclay University
Experiences
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2017Research engineer (IR) Bioinformatics and Biostatistics Hub (Pasteur C3BI)
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2015Research engineer (IR) (2 years) Institut Français de Bioinformatique (CNRS UMS 3601)
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2012Phd Student (3 years) LRI Université Paris-Sud
Publications
Télécharger-
2024BioFlow-Insight: facilitating reuse of Nextflow workflows with structure reconstruction and visualization., NAR Genom Bioinform 2024 Sep; 6(3): lqae092.
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2022A comprehensive resource for Bordetella genomic epidemiology and biodiversity studies., Nat Commun 2022 Jul; 13(1): 3807.
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2021High-Resolution Typing of Staphylococcus epidermidis Based on Core Genome Multilocus Sequence Typing To Investigate the Hospital Spread of Multidrug-Resistant Clones., J Clin Microbiol 2021 Feb; 59(3): .
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2021Viral Host Range database, an online tool for recording, analyzing and disseminating virus-host interactions., Bioinformatics 2021 Feb; (): .
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2021The iPPI-DB initiative: a community-centered database of protein-protein interaction modulators., Bioinformatics 2021 Apr; 37(1): 89-96.
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2018A reusable tree-based web-visualization to browse EDAM ontology, and contribute to it., JOSS 2018.
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2015Agrégation de classements avec égalités: algorithmes, guides à l’utilisateur et applications aux données biologiques, Thesis.
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2015Rank aggregation with ties: Experiments and analysis, PVLDB 2015.
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2015Interrogation de bases de données biologiques publiques par reformulation de requêtes et classement des résultats avec ConQuR-Bio, JOBIM 2015.
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2014Similarity search for scientific workflows, PVLDB 2014.
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