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Maladies
Organismes
Applications
Technique
Date de Début
03
Aug 2015
Statut
Ongoing
Membres
1
Structures
1

Présentation

PDBCrystal StructuresResolution (A)Year

NON-VIRAL proteins

Eukariotyc cell-cell fusion
4OJCWild-type full-length trimeric ectodomain of C. elegans fusion protein EFF-1 2.932014
4OJDC-ter truncated trimeric ectodomain of C. elegans fusion protein EFF-1 G260A/D321E/D322E mutant 2.262014
4OJEC-ter truncated trimeric ectodomain of C. elegans fusion protein EFF-1 2.57 2014

VIRAL proteins

Flaviviridae family

Pestiviruses
Bovine viral diarrhea virus
4DVKGlycoprotein Erns from pestivirus BVDV-1 strain NCP-72.202012
4DVLGlycoprotein Erns from pestivirus BVDV-1 in complex with 2′-3′-cyclo-UMP2.752012
4DVNGlycoprotein Erns from pestivirus BVDV-1 in complex with 2′-UMP2.382012
4DW3Glycoprotein Erns from pestivirus BVDV-1 in complex with 5′-CMP2.352012
4DW4Glycoprotein Erns from pestivirus BVDV-1 in complex with 5′-UMP2.232012
4DW5Glycoprotein Erns from pestivirus BVDV-1 in complex with a non-cleavable CpU dinucleotide2.212012
4DW7Active-site mutant (H32K) Erns from pestivirus BVDV-1 in complex with a CpU dinucleotide3.072012
4DWAActive-site mutant (H32K) Erns from pestivirus BVDV-1 in complex with a CpUpC trinucleotide3.012012
4DWCGlycoprotein Erns from the pestivirus BVDV-1 in complex with Zn ions2.892012
Flaviviruses
Dengue virus
3UZVDomain III of the envelope protein E from DENV 2 with the variable domains of Mab 4E112.102012
3UZQDomain III of the envelope protein E from DENV 1 with the variable domains of Mab 4E111.602012
3UZEDomain III of the envelope protein E from DENV 3 with the variable domains of Mab 4E112.042012
3UYPDomain III of the envelope protein E from DENV 4 with the variable domains of Mab 4E112.002012
3UC0Domain I of the envelope protein E from DENV 4 with Fab of the chimpanzee monoclonal Ab 5H22.712011
3UAJEnvelope glycoprotein ectodomain E from DENV 4 with Fab of the chimpanzee monoclonal Ab 5H23.232011
Tick-Borne Encephalitis Virus
1URZPost-fusion form of the envelope glycoprotein E from Tick-Borne Encephalitis virus2.702004
1SVBPre-fusion form of the envelope glycoprotein E from Tick-Borne Encephalitis virus1.901996
Hepaciviruses
Hepatitis C Virus
4JZNBroadly neutralizing human anti-Hepatitis C virus glycoprotein E2 Fab fragment HC84-12.052013
4JZOBroadly neutralizing human anti-Hepatitis C virus (HCV) glycoprotein E2 Fab fragment HC84-272.222013
4JVPBroadly neutralizing anti-Hepatitis C virus (HCV) glycoprotein E2 alpaca nanobody D031.762013
3U6RBroadly neutralizing anti-Hepatitis C virus (HCV) glycoprotein E2 single chain FV fragment 1:72.672011
1GX5Hepatitis C virus RNA polymerase in complex with ribonucleotides1.702002
1CSJRNA-dependent RNA polymerase of Hepatitis C virus2.801999

Togaviridade family

Alphaviruses
Chikungunya virus
3N40Immature envelope glycoproteins p62-E1 of Chikungunya virus2.172010
3N41Mature envelope glycoproteins complex (spontaneous cleavage) of Chikungunya virus3.012010
3N42Mature envelope glycoproteins complex (furin cleavage) of Chikungunya virus3.002010
3N43Mature envelope glycoproteins complex (trypsin cleavage) of Chikungunya virus2.582010
3N44Mature envelope glycoproteins complex (trypsin cleavage; osmium soak) of Chikungunya virus2.352010
2XFBFit of the Chikungunya E2-E1 envelope glycoproteins into Sindbis virus cryo-EM map9.002010
2XFCFit of the Chikungunya E2-E1 envelope glycoproteins into Semliki Forest virus cryo-EM map9.002010
Semliki Forest virus
2V33Domain III of E1 fusion glycoprotein from Semliki Forest virus1.552008
2ALASemliki Forest virus envelope protein E1 in its monomeric conformation3.002006
1I9WPre-fusion form of the envelope glycoprotein E1 from Semliki Forest virus3.002004
1RERPost-fusion form of the envelope glycoprotein E1 from Semliki Forest virus3.202004
Rubiviridae
Rubella virus
4ADIPost-fusion form of the envelope fusion protein E1 from Rubella virus (Na+)1.782013
4ADGPost-fusion form of the envelope fusion protein E1 from Rubella virus (Ca+, soak Gal3S) 2.182013
4ADJPost-fusion form of the envelope fusion protein E1 from Rubella virus (Ca+ 1mM) 1.942013
4B3VPost-fusion form of the envelope fusion protein E1 from Rubella virus (Ca+, 20mM) 1.982013

Retroviridae family

Human immunodeficiency virus (HIV-1)
2XT1HIV-1 capsid protein C-terminal domain (146-231) in complex with a camelid VHH1.322011
2XV6HIV-1 capsid protein C-terminal domain (146-220) in complex with a camelid VHH1.902011
2XXCCamelid VHH raised against the HIV-1 capsid protein C-terminal domain1.672011
2XXMHIV-1 capsid C-terminal domain in complex with a Camelid VHH and the CAI peptide1.652011
3DPHHIV-1 capsid C-terminal domain mutant (L211S)2.012008
3DS0HIV-1 capsid C-terminal domain mutant (N183A) in complex with an inhibitor of particle assembly1.602008
3DS1HIV-1 capsid C-terminal domain mutant (E187A) in complex with an inhibitor of particle assembly1.602008
3DS2HIV-1 capsid C-terminal domain mutant (Y169A)1.202008
3DS3HIV-1 capsid C-terminal domain mutant (Y169A) in complex with an inhibitor of particle assembly2.702008
3DS4HIV-1 capsid C-terminal domain mutant (L211S) in complex with an Inhibitor of particle assembly1.122008
3DS5HIV-1 capsid C-terminal domain mutant (N183A)2.402008
3DTJHIV-1 capsid C-terminal domain mutant (E187A)4.002008
2BUOHIV-1 capsid C-terminal domain in complex with an inhibitor of particle assembly1.702005
Endogenous retrovirus
1Y4MHuman endogenous retrovirus HERV-FRD envelope protein (syncitin-2)1.602005

Arenaviridae family (arenavirus)

Lymphocytic Choriomeningitis virus
3MKOLymphocytic Choriomeningitis virus membrane fusion glycoprotein GP2 in post-fusion form1.802011
Herpesviridae family
Pseudorabies virus
2XQYPseudorabies core fragment of glycoprotein H in complex with Fab D6.32.052010

Paramyxoviridae family

Respiratory Syncitial Virus
2WJ8Respiratory Syncitial virus nucleocapsid-RNA decameric rings3.292009

Rhabdoviridae family

Vesicular Stomatitis Virus
2J6JPre-fusion form of the Vesicular Stomatitis virus glycoprotein G ectodomain3.002007
2CMZVSV-Indiana glycoprotein in its acidic conformation2.402006
Coronaviridae family
Coronavirus
1WYYPost-fusion hairpin conformation of the SARS Coronavirus spike glycoprotein2.202005
 Other viruses  

Dicistroviridae family

3NAPTriatoma virus (TrV)2.502010

Picornaviridae family

2VF1Capsid of the Picobirnavirus3.402005

Birnaviridae family

3IDEAquabirnavirus (IPNV) subviral particle3.352009
1WCDBirnavirus IBDV T1 virus-like particle3.002005
1WCEBirnavirus IBDV T13 viral particle7.002005

Reoviridae family

1QHDMajor capsid protein VP6 of group A rotavirus1.952001

Non-viral structures

4ACQAlpha-2 macroglobulin4.202012
2J6EAutoimmune complex between a human IGM rheumatoid factor and IGG1 Fc3.002007