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Cours

1ème Ecole de Bioinformatique AVIESAN – IFB – INSERM Niveau 2

Domaines Scientifiques
Maladies
Organismes
Applications
Technique
Date de Début
25
May 2021
Date de Fin
28
May 2021
Heure
09:00:00
Roscoff, France
Adresse
2021-05-25 09:00:00 2021-05-28 18:00:00 Europe/Paris 1ème Ecole de Bioinformatique AVIESAN – IFB – INSERM Niveau 2 Objectifs La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets “Next Generation Sequencing” (NGS). Cette édition de l’école aborde les nouveaux enjeux technologiques: elle s’articulera autour de trois ateliers thématiques en session […] Roscoff, France Rachel Legendre rachel.legendre@pasteur.fr

Objectifs

La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets “Next Generation Sequencing” (NGS). Cette édition de l’école aborde les nouveaux enjeux technologiques: elle s’articulera autour de trois ateliers thématiques en session parallèle (RNA-seq, ChIP-seq, variants DNA-seq), et abordera la visualisation et l’intégration des données.

L’école vise à approfondir les concepts, à manipuler des outils informatiques avancés et à en interpréter les résultats. Elle est basée sur une alternance de courtes sessions théoriques et d’ateliers pratiques. Les participants bénéficieront d’un tutorat personnalisé pour élaborer leur plan d’analyse, et effectuer les premières étapes de traitement de leurs propres données ou de celles de leur équipe.

Attention : le tutorat n’a pas pour vocation de réaliser l’analyse complète des données des participants.

Public visé

Cette formation est destinée aux biologistes (ingénieurs, doctorants, chercheurs, enseignants-chercheurs, praticiens…) confrontés à l’analyse de données NGS, et qui cherchent à consolider leurs connaissances en bioinformatique afin d’analyser des plans expérimentaux relativement complexes.

Prérequis

Les candidats doivent avoir acquis les compétences enseignées durant l’école de niveau 1: un niveau de base en ligne de commande, R, et (au choix) RNA-seq, ChIP-seq ou variants DNA-seq.


Renseignements
: ecole-bioinfo@aviesan.fr

Informations et inscriptions : https://ressources.france-bioinformatique.fr/fr/evenements/ebaii2021n2

Compte twitter : https://twitter.com/EBAI_Roscoff

Coordination scientifique : Erwan Corre (CNRS), Jacques van Helden (IFB), Matthias Zytnicki (INRA), Rachel Legendre (Institut Pasteur).


Formateurs et tuteurs
: Une trentaine de formateurs et tuteurs provenant des organismes et universités suivants: CNRS, INRA, Inserm, Institut Curie, Institut Pasteur, Institut Gustave Roussy, ENS, Aix-Marseille Université, Sorbonne Université. Avec le soutien de l’Institut Français de Bioinformatique (IFB) et d’AVIESAN (Alliance Nationale pour les Sciences de la Vie et de la Santé).

Coordination administrative
: Aviesan ITMO GGB, Inserm, IFB.

Localisation

Localisation: Roscoff, France