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English version at the end
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Ingénieur·e de recherche en bioinformatique – développement Web et bases de données (H/F)
Le Hub de Bioinformatique et de Biostatistique, a été créé en 2015 pour apporter un soutien aux Unités et Plateformes de l’Institut Pasteur, dans ces domaines. Le Hub assure cette mission par le biais de :
- Collaborations sur des projets scientifiques soumis par les équipes de recherche de l’Institut,
- Formations dédiées pour le personnel de l’institut Pasteur de Paris ou des autres Instituts Pasteur du réseau,
- Développements d’outils et d’applications à destination de la communauté scientifique,
- Interactions directes sous la forme de questions simples.
Dans ce cadre, et afin de renforcer son pôle de développement d’applications Web et bases de données, le Hub recrute un·e ingénieur·e de recherche, pour permettre la prise en charge des demandes croissantes.
Missions :
La mission principale est d’apporter un soutien aux unités de recherche et plateformes de l’Institut au travers de la conception, du développement et de la maintenance d’applications Web dédiées à la publication et/ou l’analyse de données scientifiques. Ce soutien prend plusieurs formes :
- Développement d’applications Web (code applicatif front et back end, base de données)
- Maintenance d’applications existantes
- Participer à la rationalisation des développements au travers de composants réutilisables (pour le déploiement, la gestion et le monitoring, ou pour des aspects plus spécifiques tels que la visualisation de données)
Compétences requises :
- Développement d’interfaces utilisateur (front-end) avec le langage Javascript, et plus spécifiquement de frameworks et librairies Javascript tels que VueJs, NuxtJs, Angular, ReactJs, etc.
- Conception et développement d’applications Web avec un framework web basé sur Python
- Conception et développement de bases de données sur des SGBD relationnels (PostgreSQL, MySQL)
- Développement de tests unitaires et de tests d’intégration
- Rédaction de documentation
- Utilisation des principaux formats d’échange de données (JSON, YAML, XML)
- Utilisation d’au moins un système de gestion de versions, préférablement git
- Utilisation d’au moins un système de forge logicielle, tel que gitlab, github ou redmine
- Familiarité avec les processus de design utilisateur (UX design)
- Maitrise de l’anglais et du français (lu, écrit, parlé)
Compétences appréciées :
L’ingénieur·e ayant vocation à participer à des projets dans des domaines liés à la bioinformatique, les connaissances suivantes constituent des atouts :
- Connaissance des concepts et outils d’intégration et de déploiement continus (ex gitlab-ci, docker, kubernetes, ansible, etc.)
- Familiarité avec la Bioinformatique, et avec les différents concepts qui s’y rapportent
- Expérience du framework Django
- Rédaction et présentation de communications scientifiques (articles scientifiques, posters, présentations orales)
- Familiarité avec le framework R/Shiny
Qualités attendues :
- Capacité à travailler en équipe
- Goût pour le travail en collaboration
- Rigueur et méthode
- Force de proposition et prise d’initiative
- Adaptabilité
- Qualités relationnelles
- Motivation à se former sur de nouvelles expertises
- Autonomie
- Goût pour les activités de service et pour le domaine biomédical
Profil :
Bac +5 en Bioinformatique ou en informatique, avec 3 ans d’expérience
Le Hub et l’Institut Pasteur s’engagent à promouvoir la parité, toutes les candidatures sont les bienvenues, sans distinction de genre ou d’origine.
Pour postuler :
Cliquer sur le lien suivant et sélectionner le profil « Développement Web » lorsqu’il sera proposé
https://hub-jobs2022.pasteur.cloud/
Vous aurez besoin d’un CV à jour, et d’une lettre de motivation. Vous pourrez ajouter les adresses mail de référents (trois maximum) que nous contacterons automatiquement lors du dépôt de votre candidature.
Contact:
Les demandes de renseignements peuvent être adressées à Christophe Malabat (christophe.malabat (at) pasteur.fr) et Hervé Ménager (hervé.ménager (at) pasteur.fr).
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English version
The Hub of Bioinformatics and Biostatistics was created in 2015 in order to provide analytical support to research units and platforms at Institut Pasteur. The Hub is committed to this mission through:
- Collaborating on scientific projects, submitted by research teams of our institute, to the Hub.
- Training scientific staff from Institut Pasteur Paris or from the other institutes of international network.
- Developing tools and applications to be shared with the broader scientific community
- Interacting directly with scientist upon specific inquiries
The Hub is hiring a research engineer to consolidate its Web Integration team in response to increasing needs.
Assignments:
Our main role is to provide support to research units and platforms of Institut Pasteur through the design, development and maintenance of Web applications dedicated to the publication and/or the analysis of scientific data. This is achieved through:
- Developing Web applications (front-end and back-end code, databases),
- Maintaining existing applications,
- Contributing to the rationalisation of software developments through the creation or adoption of reusable components (for deployment, management, monitoring, or for more specific such as data visualization).
Essential expertise:
- User interfaces development, using Javascript, more specifically frameworks and and libraries such as VueJs, NuxtJs, Angular, ReactJs, etc.
- Design and development of Web applications using a Python-based framework.
- Design and development of databases using relational RDBMSs (PostgreSQL, MySQL).
- Development of unit and integration tests.
- Creation and maintenance of documentation.
- Usage of main data exchange formats (JSON, YAML, XML).
- Usage of at least one version management system, preferably git.
- Usage of at least one software forge system, such as gitlab, github, or redmine.
- Familiarity with User Centered Design processes (UX design)
- Working proficiency in French and English
Welcome but not required:
The succesfull candidate will contribute to bioinformatics-related projects, therefore the following expertises are welcome:
- Knowledge of the concepts and tools of continuous integration and deployment (e.g. gitlab CI, Docker, Kubernetes, Ansible, etc.)
- Familiarity with the Bioinformatics domain
- Experience with the Django framework
- Writing and presenting scientific communications (scientific papers, posters, oral presentations)
- Familiarity with the R/Shiny framework
Expected soft skills:
- Ability to work in a team (teamwork skills);
- Sense of collaborative work;
- Thoroughness and organising skills;
- Great sense of initiative and anticipation;
- Adaptiveness;
- Communication skills;
- Willingness to continuously learn new expertises;
- Self-reliance / autonomy;
- Sense of service activities and the biomedical domain.
Education:
Master2 degree in Bioinformatics or Computer Science, with 3 years of professional experience.
The Hub and Institut Pasteur are committed to promote parity; all applications are welcome without distinction of gender or origin.
To apply:
Click on the following link and select the corresponding profile “statistics” when this will be proposed:
https://hub-jobs2022.pasteur.cloud/
Please, submit your updated CV and a cover letter (motivational letter). You will be able to indicate contact information for reference letters (3 max.). They will be automatically contacted as soon as you validate your application.
Contact:
Informal inquiries about this position may be addressed to Christophe Malabat (christophe.malabat (at) pasteur.fr) and Hervé Ménager (herve.menager (at) pasteur.fr).