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Publication : Microbiology resource announcements

Complete Genome Sequences of Bordetella pertussis Clinical Isolate FR5810 and Reference Strain Tohama from Combined Oxford Nanopore and Illumina Sequencing

Équipe: Biodiversité et Épidémiologie des Bactéries Pathogènes
Membre : Valérie Bouchez
Domaines Scientifiques
Maladies
Organismes
Applications
Technique

Publié sur Microbiology resource announcements - 15 nov. 2018

Bouchez V, Baines SL, Guillot S, Brisse S

Lien vers Pubmed [PMID] – 30533789

Microbiol Resour Announc 2018 Nov;7(19)

Here, we describe the complete genome sequences of two Bordetella pertussis strains, FR5810, a clinical isolate recovered from the respiratory tract of an infant, and Tohama, a key reference strain for the species. Sequences were obtained using a hybrid approach combining Oxford Nanopore Technologies MinION and Illumina NextSeq 500 sequence data.