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2023aKmerBroom: Ancient oral DNA decontamination using Bloom filters on k-mer sets., iScience 2023 Nov; 26(11): 108057.
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2023decOM: similarity-based microbial source tracking of ancient oral samples using k-mer-based methods., Microbiome 2023 Nov; 11(1): 243.
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2021Strainberry: automated strain separation in low-complexity metagenomes using long reads., Nat Commun 2021 07; 12(1): 4485.