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Maladies
Organismes
Applications
Technique
Date de Début
07
Oct 2019
Date de Fin
11
Nov 2019
Heure
09:30:00
28 Rue du Dr Roux, Paris, France
Adresse
Bâtiment: Le Pasteur
Localisation
2019-10-07 09:30:00 2019-11-11 17:30:00 Europe/Paris Introduction à la Phylogénie Moléculaire : Concepts, méthodes et interprétation Ce cours a pour objectif de donner les bases théoriques et pratiques, ainsi que les bonnes pratiques nécessaires au démarrage de travaux en phylogénie et épidémiologie moléculaires. Les sessions théoriques donneront les bases du […] 28 Rue du Dr Roux, Paris, France Frédéric LEMOINE frederic.lemoine@pasteur.fr

Ce cours a pour objectif de donner les bases théoriques et pratiques, ainsi que les bonnes pratiques nécessaires au démarrage de travaux en phylogénie et épidémiologie moléculaires. Les sessions théoriques donneront les bases du domaine (représentation des arbres, modèles stochastiques d’évolution, datation) et présenteront les principales méthodes d’inférence d’arbres phylogénétiques (distance, parcimonie, maximum de vraisemblance, méthodes bayésiennes et méthodes phylogénomiques). Les sessions pratiques porteront sur l’application de ces méthodes à l’analyse de différents types de données (marqueurs moléculaires, données phylogénomiques, etc.) à l’aide d’outils adaptés tels que PhyML, IQTree, GBlocks, SeaView, LSD2, PAML et MrBayes.

Localisation

Localisation: 28 Rue du Dr Roux, Paris, France