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Publication : BMC research notes

No evidence for viral sequences in five lepidic adenocarcinomas (former “BAC”) by a high-throughput sequencing approach

Équipe: Biomics
Membre : Christiane Bouchier
Domaines Scientifiques
Maladies
Organismes
Applications
Technique

Publié sur BMC research notes - 15 déc. 2015

Berthet N, Frangeul L, Olaussen KA, Brambilla E, Dorvault N, Girard P, Validire P, Fadel E, Bouchier C, Gessain A, Soria JC

Lien vers Pubmed [PMID] – 26667652

BMC Res Notes 2015;8:782

BACKGROUND: The hypothesis of an infectious etiology of the formerly named bronchiolo-alveolar carcinoma (BAC) has raised controversy. We investigated tumor lung tissues from five patients with former BAC histology using high-throughput sequencing technologies to discover potential viruses present in this type of lung cancer. Around 180 million single reads of 100 bases were generated for each BAC sample.

RESULTS: None of the reads showed a significant similarity for Jaagsiekte sheep retrovirus (JSRV) and no other viruses were found except for endogenous retroviruses.

CONCLUSIONS: In conclusion, we have demonstrated the absence of JSRV and other known human viruses in five samples of well-characterized lepidic adenocarcinoma.