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© Institut Pasteur
Cristaux de cellulase, enzyme purifiée de Clostridium thermocellum permettant la digestion de la cellulose. Image colorisée.
Publication : Nucleosides, nucleotides & nucleic acids

Looking for new pyrimidine acyclic nucleotide analogues designed for phosphorylation by human UMP-CMP kinase

Domaines Scientifiques
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Publié sur Nucleosides, nucleotides & nucleic acids - 01 Jan 2007

Topalis D, Kumamoto H, Alexandre JA, Dugué L, Pochet S, Berteina-Raboin S, Agrofoglio LA, Deville-Bonne D

Lien vers Pubmed [PMID] – 18066785

Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids 2007;26(10-12):1369-73

Human UMP-CMP kinase is involved in the phosphorylation of nucleic acid precursors and also in the activation of antiviral analogues including cidofovir, an acyclic phosphonate compound that mimicks dCMP and shows a broad antiviral spectrum. The binding of ligands to the enzyme was here investigated using a fluorescent probe and a competitive titration assay. At the acceptor site, the enzyme was found to accommodate any base, purine and pyrimidine, including thymidine. A method for screening analogues based on their affinity for the UMP binding site was developed. The affinities of uracil vinylphosphonate derivatives modified in the 5 position were found similar to (d)UMP and (d)CMP and improved when compared to cidofovir.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18066785