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© Adeline Mallet
Nématodes Caenorhabditis elegans en microscopie électronique à balayage.
Publication : Nature structural & molecular biology

Global effects of the CSR-1 RNA interference pathway on the transcriptional landscape

Domaines Scientifiques
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Publié sur Nature structural & molecular biology - 30 Mar 2014

Cecere G, Hoersch S, O'Keeffe S, Sachidanandam R, Grishok A

Lien vers Pubmed [PMID] – 24681887

Nat. Struct. Mol. Biol. 2014 Apr;21(4):358-65

Argonaute proteins and their small RNA cofactors short interfering RNAs are known to inhibit gene expression at the transcriptional and post-transcriptional levels. In Caenorhabditis elegans, the Argonaute CSR-1 binds thousands of endogenous siRNAs (endo-siRNAs) that are antisense to germline transcripts. However, its role in gene expression regulation remains controversial. Here we used genome-wide profiling of nascent RNA transcripts and found that the CSR-1 RNA interference pathway promoted sense-oriented RNA polymerase II transcription. Moreover, a loss of CSR-1 function resulted in global increase in antisense transcription and ectopic transcription of silent chromatin domains, which led to reduced chromatin incorporation of centromere-specific histone H3. On the basis of these findings, we propose that the CSR-1 pathway helps maintain the directionality of active transcription, thereby propagating the distinction between transcriptionally active and silent genomic regions.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24681887