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Publié sur mBio - 28 juin 2022

Stéphane Bretagne, Karine Sitbon, Marie Desnos-Ollivier, Dea Garcia-Hermoso, Valérie Letscher-Bru, Sophie Cassaing, Laurence Millon, Florent Morio, Jean-Pierre Gangneux, Lilia Hasseine, Loïc Favennec, Estelle Cateau, Eric Bailly, Maxime Moniot, Julie Bonhomme, Nicole Desbois-Nogard, Taieb Chouaki, André Paugam, Bernard Bouteille, Marc Pihet, Frédéric Dalle, Odile Eloy, Milène Sasso, Magalie Demar, Patricia Mariani-Kurkdjian, Vincent Robert, Olivier Lortholary, Françoise Dromer, The French Mycoses Study Group, Céline Damiani, Hervé Dupont, Julien Maizel, Anne Totet, Jean-Philippe Bouchara, Anne Pauline Bellanger, Ana Berceanu, Jean Christophe Navellou, Emeline Scherer, Philippe Abboud, Christine Aznar, Denis Blanchet, Félix Djossou, Sophie Cayot, Cyril Garrouste, Olivier Lesens, Cécile Moluçon, Céline Nourrisson, Philippe Poirier, Éloïse Bailly, Louise Basmaciyan, Bouhemad Belaid, Mathieu Blot, Denis Caillot, Pierre-Emmanuel Charles, Jean Pierre Quenot, Emmanuelle Amazan, Emilie Baubion, André Cabie, Cyrille Chabartier, Christophe Deligny, Violaine Emal, Olivier Flechelle, Yves Hatchuel, Yohann Le Govic, Harold Merle, Charline Miossec, Jean-Marie Turmel, Ruddy Valentino, Marie-Fleur Durieux, Pascal Turlure, Victor Mercier, Martine Gari-Toussaint, Karine Risso, Loïc Simon, Cedric Bretonnière, David Boutoille, Thomas Gastinne, Karim Lakhal, Elise Launay, Thierry Lepoivre, Pierre Peterlin, Fanny Rialland, Patrice Le Pape, Etienne Canoui, Naima Dahane, Solène Kerneis, Cécile Angebault, Marie-Elisabethh Bougnoux, Nadia Guennouni, Fanny Lanternier, Bennedicte Neven, Mehdi Oualha, Anne Scemla, Emilie Sitterlé, Felipe Suarez, Julie Toubiana, Stéphane Bonacorci, Alexandre Alanio, Anne Bergeron, Blandine Denis, Maud Gits-Muselli, Samia Hamane, Sophie Touratier, Christine Chaumeil, Lilia Merabet, Joelle Claudéon, Elodie Curlier, Valérie Galantine, Jean Claude Gallois, Samuel Markowicz, Muriel Nicolas, Pascal Musson, Kinda Schepers, Alida Minoza, Catherine Kauffmann-Lacroix, Hélène Guégan, Damien Costa, Marion Dehais, Gilles Gargala, Odile Bajolet, Firouze Banisadr, Joel Cousson, Chantal Himberlin, Antoine Huguenin, Dominique Toubas, Pierre Flori, Caroline Mahinc, Hélène Raberin, Julie Denis, Raoul Herbrecht, Paul-Michel Mertes, Fehrat Meziani, Marcela Sabou, Francis Schneider, Anne-Isabelle Bertozzi, Pamela Chauvin, Elena Charpentier, Olivier Cointault, Claire Cottrel, Karen Delavigne, Stanislas Faguer, Judith Fillaux, Emilie Guemas, Xavier Iriart, Lucie Lelièvre, Jean Ruiz, Frédéric Bastides, Adélaïde Chesnay, Guillaume Desoubeaux, Audrey Therby, Elisabeth Chachaty, Bertrand Gachot

Lien vers Pubmed [PMID] – 35499498

Lien vers HAL – univ-angers-03658941

Lien DOI – 10.1128/mbio.00920-22

mBio, 2022, 13 (3), pp.e0092022. ⟨10.1128/mbio.00920-22⟩

The French National Reference Center for Invasive Mycoses and Antifungals leads an active and sustained nationwide surveillance program on probable and proven invasive fungal diseases (IFDs) to determine their epidemiology in France. Between 2012 and 2018, a total of 10,886 IFDs were recorded. The incidence increased slightly over time (2.16 to 2.36/10,000 hospitalization days, P = 0.0562) in relation with an increase of fungemia incidence (1.03 to 1.19/10,000, P = 0.0023), while that of other IFDs remained stable. The proportion of ≥65-year-old patients increased from 38.4% to 45.3% (P < 0.0001). Yeast fungemia (n = 5,444) was due mainly to Candida albicans (55.6%) with stable proportions of species over time. Echinocandins became the main drug prescribed (46.7% to 61.8%), but global mortality rate remained unchanged (36.3% at 1 month). Pneumocystis jirovecii pneumonia (n = 2,106) was diagnosed mostly in HIV-negative patients (80.7%) with a significantly higher mortality than in HIV-positive patients (21.9% versus 5.4% at 1 month, P 60% of the cases) with a global mortality rate of 42.5% and 59.3%, respectively, at 3 months and significant changes in diagnosis procedure over time. More concurrent infections were also diagnosed over time (from 5.4% to 9.4% for mold IFDs, P = 0.0115). In conclusion, we observed an aging of patients with IFD with a significant increase in incidence only for yeast fungemia, a trend toward more concurrent infections, which raises diagnostic and therapeutic issues. Overall, global survival associated with IFDs has not improved despite updated guidelines and new diagnostic tools. IMPORTANCE The epidemiology of invasive fungal diseases (IFDs) is hard to delineate given the difficulties in ascertaining the diagnosis that is often based on the confrontation of clinical and microbiological criteria. The present report underlines the interest of active surveillance involving mycologists and clinicians to describe the global incidence and that of the main IFDs. Globally, although the incidence of Pneumocystis pneumonia, invasive aspergillosis, and mucormycosis remained stable over the study period (2012 to 2018), that of yeast fungemia increased slightly. We also show here that IFDs seem to affect older people more frequently. The most worrisome observation is the lack of improvement in the global survival rate associated with IFDs despite the increasing use of more sensitive diagnostic tools, the availability of new antifungal drugs very active in clinical trials, and a still low/marginal rate of acquired in vitro resistance in France. Therefore, other tracks of improvement should be investigated actively.