Dans le cadre des missions définies par l’arreté du 29 novembre 2004 (fixant les modalités de désignation et les missions des CNR) , Le CNR des virus influenzae est désigné par le Ministère en charge de la Santé, et plus particulièrement par la Direction Générale de la Santé (DGS) et par l’Institut de Veille Sanitaire (InVS), pour assurer la surveillance microbiologique des infections à virus influenza Les missions spécifiques du CNR, telles que définies au cahier des charges de l’appel à candidature (InVS – janvier 2011) sont :
1. Apporter une expertise microbiologique :
- Caractériser les souches de grippe isolées en Métropole et dans les DOM (sous-typage, caractéristiques antigéniques, analyse génétique),
- Développer et diffuser les techniques de diagnostic et d’identification des virus influenza,
- Contribuer à l’identification et à la surveillance des souches résistantes aux antiviraux,
- Etudier l’adéquation de la composition du vaccin contre la grippe au regard des souches virales circulantes,
- Analyser et sélectionner les souches de grippe les plus pertinentes pour les envoyer vers les centres mondiaux de référence dans le cadre de la collaboration avec les centres de référence de l’OMS,
- Disposer d’un accès, en tant que de besoin, à un laboratoire de haute sécurité,
- Maintenir une expertise sur le coronavirus responsable du SRAS (technique diagnostique, caractérisation du virus, etc.) et les autres virus respiratoires,
2. Contribuer à la surveillance épidémiologique en lien avec l’Institut de Veille sanitaire :
- Contribuer à la surveillance virologique de la grippe (détection des virus grippaux circulants sur le territoire et évolution hebdomadaire du nombre et des caractéristiques des souches circulantes) en lien avec les structures concernés (réseaux de médecins, d’établissements hospitaliers), et en lien avec les Cire concernées pour les DOM ;
- Contribuer au réseau européen de surveillance en diffusant les données virologiques sur les virus grippaux recueillies en France,
- Mettre en place une surveillance virologique adaptée en cas de menace pandémique et développer des outils de diagnostics adaptés (PCR, tests sérologiques…),
- Contribuer à la surveillance microbiologique et épidémiologique des autres agents pathogènes responsables de syndromes grippaux en métropole et dans les DOM,
- Contribuer à la surveillance des souches grippales chez l’animal, en particulier aviaires et collaborer avec des laboratoires experts dans le domaine de la surveillance animale,
- Contribuer à la mise en place de la surveillance unifiée régionalisée de la grippe.
3. Contribuer à l’alerte en signalant à l’Institut de veille sanitaire tout événement inhabituel : mutation, émergence d’une nouvelle souche, apparition de résistance aux antiviraux, formes cliniques inhabituelles… 4. Expertise et conseil :
- Apporter son expertise aux autorités de santé dans le domaine de la prévention et du contrôle de la grippe
- Contribuer aux travaux de préparation à une pandémie grippale de la Direction Générale de la Santé,
Intérêt pour la santé publique
Dans le cadre de sa mission de santé publique, le CNR participe à la surveillance virologique de la circulation des virus grippaux et autres virus respiratoires responsables de syndromes grippaux ou d’Infections Respiratoires Aigües (IRA) en France dans la population et en milieu hospitalier. Ils assurent également le suivi en termes d’ampleur et d’impact des épidémies de grippe saisonnière ou liées à d’autres virus respiratoires tels que le Virus Respiratoire Syncytial (VRS) ou les rhinovirus humains. La détection des premiers virus grippaux en métropole permet de donner l’alerte auprès des autorités de santé (InVS et DGS). Le CNR a également pour mission d’assurer l’identification et la caractérisation antigénique et génétique des virus grippaux responsables des épidémies annuelles afin notamment d’évaluer l’adéquation de la composition vaccinale avec les virus grippaux circulants ainsi que d’apprécier l’évolution de la résistance naturelle ou acquise post traitement aux antiviraux. Par ailleurs, dans le contexte de risque pandémique lié à la survenue de cas d’infection zoonotique par des virus grippaux d’origine animale tells que les virus de grippe aviaire A(H5N1) ou A(H7N9), le CNR effectue l’analyse virologique des prélèvements en cas de suspicion d’infection zoonotique. Le cas échéant, en cas de diagnostic positif de virus de grippe animale, il a en charge d’en réaliser l’isolement et de caractériser la souche virale en cause.
