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Publication : Molecular cell

Evolutionary and mechanistic diversity of Type I-F CRISPR-associated transposons.

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Publié sur Molecular cell - 03 févr. 2022

Klompe SE, Jaber N, Beh LY, Mohabir JT, Bernheim A, Sternberg SH

Lien vers Pubmed [PMID] – 35051352

Lien DOI – 10.1016/j.molcel.2021.12.021

Mol Cell 2022 Feb; 82(3): 616-628.e5

Canonical CRISPR-Cas systems utilize RNA-guided nucleases for targeted cleavage of foreign nucleic acids, whereas some nuclease-deficient CRISPR-Cas complexes have been repurposed to direct the insertion of Tn7-like transposons. Here, we established a bioinformatic and experimental pipeline to comprehensively explore the diversity of Type I-F CRISPR-associated transposons. We report DNA integration for 20 systems and identify a highly active subset that exhibits complete orthogonality in transposon DNA mobilization. We reveal the modular nature of CRISPR-associated transposons by exploring the horizontal acquisition of targeting modules and by characterizing a system that encodes both a programmable, RNA-dependent pathway, and a fixed, RNA-independent pathway. Finally, we analyzed transposon-encoded cargo genes and found the striking presence of anti-phage defense systems, suggesting a role in transmitting innate immunity between bacteria. Collectively, this study substantially advances our biological understanding of CRISPR-associated transposon function and expands the suite of RNA-guided transposases for programmable, large-scale genome engineering.