Marc Lecuit

Présentation

Une approche intégrative pour mieux comprendre et combattre
l’encéphalite infectieuse de l’enfant

Les encéphalites sont des infections aigües du système nerveux central associées à des troubles neurologiques. Les étiologies les plus fréquentes sont d’origine bactériennes ou virales. En Asie, les encéphalites aigües sont un enjeu de santé publique majeur puisque celles-ci sont parmi les causes les plus fréquentes d’hospitalisation pédiatrique (virus de dengue, de l’encéphalite japonaise, virus EV71). Malgré des investigations microbiologiques extensives et l’utilisation de tests de biologie moléculaire les plus avancés, l’étiologie des encéphalites reste inconnue dans presque la moitié des cas.

Le programme SEAe (SouthEast Asia encephalitis) a été lancé afin de répondre aux enjeux de santé publique et de recherche que suscitent les encéphalites en Asie du Sud-Est. Cette initiative inter-institutionnelle et multidisciplinaire majeure implique à l’heure actuelle quatre pays du Sud-Est Asiatique (Cambodge, Laos, Vietnam et Birmanie), et la France. Ce programme a pour objectif :

De renforcer les capacités de diagnostic et de prise en charge clinique des patients atteints d’encéphalite ;
De développer les connaissances biomédicales sur les encéphalites (e.g. physiopathologie, séquelles à long terme, …) ;
De générer des données extensives sur les étiologies, fréquentes ou rares, des encéphalites ;
D’identifier des agents pathogènes responsables de cas d’encéphalite inconnus à ce jour ;
D’identifier et analyser les facteurs liés aux regroupements de cas d’encéphalite en intégrant les facteurs de santé humaine, de santé animale et environnementaux dans une approche dite « One Health » ;
D’émettre des recommandations à l’intention des autorités de santé publiques locales et aider à la mise en œuvre d’un système de surveillance régional qui aide à définir les politiques de prévention et de vaccination et prépare aux risques infectieux émergents.

Clinical activities

The workpackage on clinical and epidemiological studies is responsible for the rigorous identification and inclusion of infectious encephalitis cases, the collection and storage of clinical data and biological samples for microbiological diagnosis. Training of medical personnel in clinical sites participating to the study is an important aspect of this workpackage mission. Identification of clusters of cases unusual by their numbers, the causative pathogen, or the clinical presentation, will trigger field investigations conducted in collaboration with the partners involved in the third component (see below). The prospective follow-up of survivors one year after discharge will document the long-term neurologic sequelae associated with acute encephalitis.

Diagnosis activities

The laboratory diagnosis, will improve the microbiological diagnosis of known pathogens by strengthening capacities in selected clinical sites and national collaborative centers, in order to provide the clinicians with state-of-the-art and timely laboratory diagnosis for the microorganisms accessible to treatment. In order to establish a harmonized diagnostic strategy, molecular diagnostic tools will be implemented allowing the detection of dozens of infectious agents known to be responsible for encephalitis in Southeast Asia. This will extend to the detection and characterization of new or unusual pathogens in the samples of unknown etiology by using a combined approach: pan-generic PCRs, cell cultures, electron microscopy, High Throughput Sequencing (HTS).

Field Investigations

The project will also document and analyze collective and environmental risk factors related to encephalitis cases in order to improve the understanding of human infectious encephalitis epidemiology in Southeast Asia, integrating potential environmental, epidemiological and sociological factors, and provide adapted surveillance, control and outbreak investigation methodologies. Indeed, recognizing the essential link between human, animal (domestic animal and wildlife) and environmental health, and the threat of disease transmission, field investigations using an interdisciplinary “One Health” approach is crucial to a better understanding of the epidemiology of diseases and, by extension, their control.

Partenaires