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© Structural Dynamics Of Macromolecules
The structure of a bacterial analog of the nicotinic receptor (one color per subunit) inserted into the cell membrane (grey and orange). A representation of the volume accessible to ions is shown in yellow.
Domaines Scientifiques
Maladies
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Publié sur - 09 oct. 2024

Nilesh B Karalkar, Tatiana Kent, Taylor Tredinnick, Leonardo Betancurt-Anzola, Marc Delarue, Richard Pomerantz, Steven A Benner

Lien vers HAL – pasteur-04769543

Lien DOI – 10.1101/2024.10.09.617423

2024

A route to prepare ribonucleoside triphosphates featuring a 3’-aminoxy (3’-O-NH2) removable blocking group is reported here. We then show that versions of two DNA polymerases, human DNA polymerase theta (Polθ) and mimiviral PrimPol, accept these triphosphates as substrates to add single nucleotides to an RNA primer under engineered conditions. Cleaving the O-N bond in the 3’-O-NH2 group within the extended primer regenerates the 3’-OH group, facilitating subsequent polymerase cycles that add a second, selected, nucleotide. These enzymes and triphosphates together enable template-independent enzymatic RNA synthesis (TIERS) exploiting a cyclic reversible termination framework. The study shows that this process is ready for instrument adaptation by using it to add three ribonucleotides in three cycles using an engineered Polθ. This work creates a new way to synthesize RNA with a de novo defined sequence, without requiring the protecting groups, hazardous solvents, and sensitive reagents that bedevil phosphoramidite-based RNA synthesis.