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Publication : Proceedings of the VLDB Endowment

Similarity search for scientific workflows

Domaines Scientifiques
Maladies
Organismes
Applications
Technique

Publié sur Proceedings of the VLDB Endowment - 01 août 2014

Johannes Starlinger, Bryan Brancotte, Sarah Cohen-Boulakia, Ulf Leser

PVLDB 2014

With the increasing popularity of scientific workflows, public repositories are gaining importance as a means to share, find, and reuse such workflows. As the sizes of these repositories grow, methods to compare the scientific workflows stored in them become a necessity, for instance, to allow duplicate detection or similarity search. Scientific workflows are complex objects, and their comparison entails a number of distinct steps from comparing atomic elements to comparison of the workflows as a whole. Various studies have implemented methods for scientific workflow comparison and came up with often contradicting conclusions upon which algorithms work best. Comparing these results is cumbersome, as the original studies mixed different approaches for different steps and used different evaluation data and metrics. We contribute to the field (i) by disecting each previous approach into an explicitly defined…