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Publication : Bioinformatics (Oxford, England)

ARIA2: automated NOE assignment and data integration in NMR structure calculation

Équipe: Bioinformatique structurale
Équipe: Dynamique fonctionnelle
Membre : Benjamin Bardiaux
Membre : Michael Nilges
Membre : Thérèse Malliavin
Domaines Scientifiques
Maladies
Organismes
Applications
Technique

Publié sur Bioinformatics (Oxford, England) - 22 nov. 2006

Rieping W, Habeck M, Bardiaux B, Bernard A, Malliavin TE, Nilges M

Lien vers Pubmed [PMID] – 17121777

Bioinformatics 2007 Feb;23(3):381-2

Modern structural genomics projects demand for integrated methods for the interpretation and storage of nuclear magnetic resonance (NMR) data. Here we present version 2.1 of our program ARIA (Ambiguous Restraints for Iterative Assignment) for automated assignment of nuclear Overhauser enhancement (NOE) data and NMR structure calculation. We report on recent developments, most notably a graphical user interface, and the incorporation of the object-oriented data model of the Collaborative Computing Project for NMR (CCPN). The CCPN data model defines a storage model for NMR data, which greatly facilitates the transfer of data between different NMR software packages.