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Publication : Scientific reports

A single Proteus mirabilis lineage from human and animal sources: a hidden reservoir of OXA-23 or OXA-58 carbapenemases in Enterobacterales.

Domaines Scientifiques
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Publié sur Scientific reports - 08 juin 2020

Bonnin RA, Girlich D, Jousset AB, Gauthier L, Cuzon G, Bogaerts P, Haenni M, Madec JY, Couvé-Deacon E, Barraud O, Fortineau N, Glaser P, Glupczynski Y, Dortet L, Naas T,

Lien vers Pubmed [PMID] – 32514057

Lien DOI – 10.1038/s41598-020-66161-z

Sci Rep 2020 06; 10(1): 9160

In Enterobacterales, the most common carbapenemases are Ambler’s class A (KPC-like), class B (NDM-, VIM- or IMP-like) or class D (OXA-48-like) enzymes. This study describes the characterization of twenty-four OXA-23 or OXA-58 producing-Proteus mirabilis isolates recovered from human and veterinary samples from France and Belgium. Twenty-two P. mirabilis isolates producing either OXA-23 (n = 21) or OXA-58 (n = 1), collected between 2013 and 2018, as well as 2 reference strains isolated in 1996 and 2015 were fully sequenced. Phylogenetic analysis revealed that 22 of the 24 isolates, including the isolate from 1996, belonged to a single lineage that has disseminated in humans and animals over a long period of time. The blaOXA-23 gene was located on the chromosome and was part of a composite transposon, Tn6703, bracketed by two copies of IS15∆II. Sequencing using Pacbio long read technology of OXA-23-producing P. mirabilis VAC allowed the assembly of a 55.5-kb structure encompassing the blaOXA-23 gene in that isolate. By contrast to the blaOXA-23 genes, the blaOXA-58 gene of P. mirabilis CNR20130297 was identified on a 6-kb plasmid. The acquisition of the blaOXA-58 gene on this plasmid involved XerC-XerD recombinases. Our results suggest that a major clone of OXA-23-producing P. mirabilis is circulating in France and Belgium since 1996.