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Publication : Journal of immunological methods

IL8 and EDEM3 gene expression ratio indicates peripheral blood mononuclear cell (PBMC) quality.

Domaines Scientifiques
Maladies
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Technique

Publié sur Journal of immunological methods - 01 févr. 2019

Kofanova O, Bellora C, Quesada RA, Bulla A, Panadero-Fajardo S, Keipes M, Shea K, Stone M, Lescuyer P, Betsou F,

Lien vers Pubmed [PMID] – 30496732

Lien DOI – 10.1016/j.jim.2018.11.012S0022-1759(18)30118-2

J Immunol Methods 2019 Feb; 465(): 13-19

Uncontrolled preanalytical variables can reduce the accuracy and reproducibility of downstream analytical results from peripheral blood mononuclear cells (PBMCs).PBMCs were isolated from EDTA and citrate-anticoagulated blood samples, obtained from healthy subjects and patients with inflammatory and infectious conditions. PBMC-derived RNA samples were examined for gene expression changes induced by extended blood pre-centrifugation delays at 4 °C and RT. We used Taqman RTqPCR to evaluate the combination of two target genes for their “diagnostic performance” in identifying EDTA and citrate-anticoagulated PBMC samples with extended pre-centrifugation times.We established the PBMC preanalytical score, a gene expression metric to asses the PBMC quality related to the pre-centrifugation delay at room temperature for different anticoagulants. The PBMC preanalytical score measurement can identify: CONCLUSION: The proposed PBMC preanalytical score may enable objective PBMC sample qualification for downstream applications, which may be influenced by blood precentrifugation delays.