Alexis Criscuolo - ASSU - Research - Institut Pasteur

Un petit guide pour l'utilisation de la recherche avancée :

Tip 1. Utilisez "" afin de chercher une expression exacte.
Exemple : "division cellulaire"
Tip 2. Utilisez + afin de rendre obligatoire la présence d'un mot.
Exemple : +cellule +stem
Tip 3. Utilisez + et - afin de forcer une inclusion ou exclusion d'un mot.
Exemple : +cellule -stem

e.g. searching for members in projects tagged cancer

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department
center
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nrc
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Personnel Administratif
Chargé(e) de Recherche Expert
Directeur(trice) de Recherche
Assistant(e) de Recherche Clinique
Infirmier(e) de Recherche Clinique
Chercheur(euse) Clinicien(ne)
Manager de département
Etudiant(e) en alternance
Professeur(e)
Professeur Honoraire
Aide technique
Etudiant(e) en Master
MD-PhD
Personnel médical
Chercheur(euse) Contractuel(le)
Personnel infirmier
Chercheur(euse) Permanent(e)
Pharmacien(ne)
Etudiant(e) en thèse
Médecin
Post-doctorant(e)
Prize
Chef(fe) de Projet
Chargé(e) de Recherche
Ingénieur(e) de Recherche
Chercheur(euse) Retraité(e)
Technicien(ne)
Etudiant(e)
Vétérinaire
Visiteur(euse) Scientifique

Appointments

Directeur(trice) Adjoint(e) de Centre
Directeur(trice) Adjoint(e) de Départment
Directeur(trice) Adjoint(e) de Centre National de Référence
Directeur(trice) Adjoint(e) de Plateforme
Directeur(trice) de Centre
Directeur(trice) de Départment
Directeur(trice) d'Institut
Directeur(trice) de Centre National de Référence
Chef(fe) de Groupe
Responsable de Plateforme
Responsable opérationnel et administratif
Responsable de Structure
Président(e) d'honneur de Département
Coordinateur(trice) du Labex

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Domaines Scientifiques

Maladies

Organismes

Applications

Technique

Technique

Genome assembly

Date de Début

01

Dec 2025

Statut

Completed

Membres

1

Structures

2

Présentation

ASSU (ASSembling SSU) is a command line tool to carry out the reference-guided assembly of small subunit (SSU) 16S ribosomal ribonucleic acid (rRNA) segments using short high-throughput sequencing (HTS) reads derived from whole genome sequencing of bacteria or archaea strains.

This tool was developed to compensate the failure of several de novo assembly programs to assemble (at least one) non-fragmented SSU segment when the sequenced genome contains different 16S rRNA copies with sequence variation, especially when using short HTS reads.

ASSU is ƒreely available at gitlab.pasteur.fr/GIPhy/ASSU. It runs on Linux and most OS X operating systems.

Publié le: 01 déc. 2025