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    Exemple : "division cellulaire"
  • Tip 2. Utilisez + afin de rendre obligatoire la présence d'un mot.
    Exemple : +cellule +stem
  • Tip 3. Utilisez + et - afin de forcer une inclusion ou exclusion d'un mot.
    Exemple : +cellule -stem
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Domaines Scientifiques
Maladies
Organismes
Applications
Technique
Date de Début
18
Nov 2015
Statut
En cours
Membres
4
Structures
1

Présentation

Illumina uses a green laser to sequence G/T and a red laser to sequence A/C. At each cycle at least one of two nucleotides for each color channel need to be read to ensure proper registration.

Protocole d'accès

It is important to maintain color balance for each base of the index read being sequenced, otherwise index read sequencing could fail due to registration failure. Please check the real sequences of each index in the table above to make sure each base position will have signal in both color channels for the index read:

index-compatiblility

For example, the following table illustrate possible pooling strategies. These represent only some of the acceptable combinations:

This recommendation is available for all index (Truseq, Nextera, “Home made” ….).

index-truseqsetA

An web application called checkMyIndex and available here has been developped at the Biomics Platform to help in finding compatible indexes according to some parameters (e.g. total number of samples or multiplexing rate).