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Publication : Journal of medical microbiology

Genome characteristics of isolates from Tunisia

Domaines Scientifiques
Maladies
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Publié sur Journal of medical microbiology - 01 Sep 2019

Ben Fraj I, Bouchez V, Smaoui H, Kechrid A, Brisse S

Lien vers Pubmed [PMID] – 31329091

J. Med. Microbiol. 2019 Sep;68(9):1320-1323

The recent increase in pertussis cases observed in some countries may have several causes, including the evolution of populations towards escape of vaccine-induced immunity. Most genomic studies of isolates performed so far are from countries that use acellular vaccines. The objective was to analyse genomic sequences of isolates collected during the 2014 whooping cough epidemic in Tunisia, a country where whole-cell vaccines are used. Ten Tunisian isolates and four vaccine strains were sequenced and compared to 169 isolates from countries where acellular vaccines are used. Phylogenetic analysis showed that Tunisian isolates are diverse, demonstrating a multi-strain 2014 epidemic peak, and are intermixed with those circulating in other world regions, showing inter-country transmission. Consistently, Tunisian isolates have antigen variant composition observed in other world regions. No pertactin-deficient strain was observed. The Tunisian population appears to be largely connected with populations from other countries.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31329091